69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3012 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  100 
 
 		 420 aa  826    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  43.13 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  38.99 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  39.15 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  38.06 
 
 		 407 aa  209  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  36.08 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  38.17 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  35.51 
 
 		 400 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  36.04 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  36.08 
 
 		 399 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  37.22 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  38.2 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  39.73 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  39.56 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  38.78 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  41.54 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  34.63 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  32.05 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.58 
 
 		 394 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  32.33 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.31 
 
 		 391 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  29.1 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  29.1 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  29.49 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  27.5 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  40.8 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  29.01 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  30.43 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.51 
 
 		 676 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  30.9 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  26.25 
 
 		 627 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 		 643 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  35.71 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.59 
 
 		 677 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 651 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2894  hypothetical protein  29.02 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.382794  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  30.77 
 
 		 631 aa  57.4  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  24.45 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 625 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  26.95 
 
 		 635 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  27.74 
 
 		 621 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.58 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4472  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.39 
 
 		 688 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0704928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  22.43 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4481  Extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 		 686 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4326  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.8 
 
 		 686 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  22.98 
 
 		 376 aa  46.6  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4462  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.62 
 
 		 686 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2167  hypothetical protein  24.39 
 
 		 674 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0901646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  22.87 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 		 378 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  21.88 
 
 		 379 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>