164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2085 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 356 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  54.46 
 
 		 378 aa  346  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  49.86 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  36.15 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 		 403 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  35.96 
 
 		 425 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  36.15 
 
 		 408 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  36.91 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  32.84 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  36.02 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  37.03 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  35.48 
 
 		 407 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  35.48 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  34.69 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  36.47 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  34.79 
 
 		 415 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  35.21 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  30.66 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  34.22 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  33.69 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  29.53 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.12 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  28.74 
 
 		 394 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  27.47 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  27.47 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  30.59 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  27.78 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  30.72 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 		 643 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  31.22 
 
 		 625 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  21.66 
 
 		 676 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.35 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  23.24 
 
 		 627 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  33.62 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  22.51 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  20.39 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  26.96 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  21.05 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  26.94 
 
 		 602 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  26.96 
 
 		 604 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  23.4 
 
 		 595 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1027  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000299575  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.48 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  25.28 
 
 		 631 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  22.15 
 
 		 447 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  24.14 
 
 		 603 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  22.65 
 
 		 451 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 		 379 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  27.35 
 
 		 604 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3551  extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  23.23 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  21.37 
 
 		 385 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  25.88 
 
 		 604 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  25.88 
 
 		 607 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  22.74 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  21.69 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.24 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  23.56 
 
 		 629 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  26.58 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  22.44 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  21.36 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  25.53 
 
 		 617 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  21.36 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  26.23 
 
 		 635 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  24.46 
 
 		 596 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  21.5 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  27.27 
 
 		 603 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.23 
 
 		 467 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  22.04 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  32.69 
 
 		 627 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  32.61 
 
 		 627 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  22.9 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  20.88 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  32.61 
 
 		 628 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1977  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.33 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212694  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  26.36 
 
 		 603 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>