139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4481 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4326  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  97.46 
 
 
686 aa  1214    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4472  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  68.66 
 
 
688 aa  869    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0704928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4481  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
686 aa  1350    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4462  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  98.98 
 
 
686 aa  1342    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  32.43 
 
 
627 aa  194  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.26 
 
 
677 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 
643 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 
651 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.95 
 
 
676 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2555  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.29 
 
 
606 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  23.87 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  22.46 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  31.05 
 
 
451 aa  73.2  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.33 
 
 
402 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 
375 aa  72  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 
374 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.7 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.36 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 
450 aa  66.6  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  23.11 
 
 
404 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 
404 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.67 
 
 
385 aa  64.7  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0302  hypothetical protein  24.4 
 
 
705 aa  64.7  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0292766  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  21.72 
 
 
391 aa  64.3  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
447 aa  63.9  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  20.7 
 
 
381 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  27.99 
 
 
631 aa  62.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  37.89 
 
 
397 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  37.89 
 
 
395 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
449 aa  62  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  25.41 
 
 
629 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  28.69 
 
 
621 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
394 aa  58.9  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  22.12 
 
 
394 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
383 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 
402 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
376 aa  57.4  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1619  extracellular ligand-binding receptor  30.86 
 
 
549 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.204825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  30.22 
 
 
383 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
369 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  25.1 
 
 
635 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  30.22 
 
 
383 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.22 
 
 
383 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 
370 aa  55.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
380 aa  55.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 
403 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 
384 aa  54.7  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  22.79 
 
 
419 aa  53.9  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
406 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  31.49 
 
 
625 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2152  hypothetical protein  23.2 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  22.17 
 
 
387 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  27.38 
 
 
628 aa  53.5  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  21.29 
 
 
390 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  21.8 
 
 
373 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  20.95 
 
 
387 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.41 
 
 
397 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
397 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.56 
 
 
371 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2263  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
369 aa  52.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0102579  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  22.53 
 
 
420 aa  52.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.83 
 
 
370 aa  52.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.56 
 
 
371 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
401 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
384 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
397 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
397 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
370 aa  51.6  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
400 aa  51.2  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0744  Extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 
381 aa  50.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
381 aa  50.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0770  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.78 
 
 
369 aa  50.8  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 
824 aa  50.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.92 
 
 
385 aa  50.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.5 
 
 
399 aa  50.8  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1162  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.39 
 
 
369 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.438916  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1037  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.39 
 
 
369 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.148346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  21.53 
 
 
388 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
370 aa  50.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
404 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  22.94 
 
 
390 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
416 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
385 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  21.95 
 
 
372 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 
421 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
372 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
795 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
795 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
412 aa  48.5  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
433 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
387 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
402 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2167  hypothetical protein  22.4 
 
 
674 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0901646  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
426 aa  48.1  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 
415 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7952  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
384 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  21.2 
 
 
377 aa  47.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0110  Extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
380 aa  47.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.54 
 
 
389 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>