More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2263 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2263  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
369 aa  740    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0102579  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.17 
 
 
396 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
377 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.3 
 
 
404 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 
395 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
376 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
384 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
398 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 
394 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
405 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  27.75 
 
 
392 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
392 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
394 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 
397 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.12 
 
 
399 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 
381 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.38 
 
 
386 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  23.01 
 
 
390 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
383 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.88 
 
 
376 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
386 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 
419 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
386 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  27.91 
 
 
383 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.93 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 
371 aa  93.6  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 
389 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.78 
 
 
399 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.35 
 
 
406 aa  92.8  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 
379 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.99 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
379 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.09 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 
401 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.66 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.21 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.66 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3551  extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 
379 aa  90.1  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
382 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  23.65 
 
 
375 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
394 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
386 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.59 
 
 
391 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 
384 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
400 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
399 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  22.04 
 
 
389 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
370 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 
382 aa  86.3  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.04 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  23.24 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  22.75 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 
397 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  22.56 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6014  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>