17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2167 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2836  hypothetical protein  55.21 
 
 		 775 aa  725    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2167  hypothetical protein  100 
 
 		 674 aa  1357    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0901646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1022  hypothetical protein  40.72 
 
 		 693 aa  416  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.515866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2152  hypothetical protein  42.29 
 
 		 451 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0302  hypothetical protein  33.39 
 
 		 705 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2894  hypothetical protein  30.15 
 
 		 644 aa  259  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.382794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 643 aa  87  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  31.29 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  25.65 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.93 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 398 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  24.39 
 
 		 420 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 399 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4326  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.98 
 
 		 686 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 421 aa  45.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4472  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.39 
 
 		 688 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0704928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>