More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0744 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0744  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
381 aa  783    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  38.69 
 
 
373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  40.41 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  35.49 
 
 
377 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.81 
 
 
382 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2831  substrate-binding protein, putative  34.33 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00332473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
372 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2947  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.752891  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  30.2 
 
 
368 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
381 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.45 
 
 
378 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  28.57 
 
 
380 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 
380 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  28.57 
 
 
372 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 
380 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 
380 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 
380 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.71 
 
 
380 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.62 
 
 
380 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.62 
 
 
380 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.62 
 
 
380 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.45 
 
 
402 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.62 
 
 
380 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.62 
 
 
376 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.67 
 
 
404 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.62 
 
 
380 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.62 
 
 
380 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
384 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 
380 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.57 
 
 
384 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
380 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
391 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
391 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
374 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.83 
 
 
380 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 
384 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 
384 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
380 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
384 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
404 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
404 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  26.73 
 
 
380 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
384 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
384 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
419 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
386 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
393 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
387 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
384 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.35 
 
 
392 aa  97.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  23.98 
 
 
402 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 
399 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
376 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
399 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  23.22 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
401 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 
814 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1619  extracellular ligand-binding receptor  36.91 
 
 
549 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.204825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 
400 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
383 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
401 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
401 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 
405 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 
373 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  22.38 
 
 
387 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  22.01 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  22.1 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.74 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
385 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  20.49 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.79 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2036  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
516 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.57 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.62 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>