103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2212 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  100 
 
 		 621 aa  1222    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  32.06 
 
 		 617 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  33.91 
 
 		 631 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  30.36 
 
 		 604 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  30.02 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  28.65 
 
 		 603 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  29.36 
 
 		 604 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  29.73 
 
 		 635 aa  170  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  27.78 
 
 		 603 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  27.38 
 
 		 661 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  27.57 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  29.75 
 
 		 602 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  27.08 
 
 		 604 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  27.08 
 
 		 604 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  27.45 
 
 		 605 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  31.64 
 
 		 628 aa  150  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  27.65 
 
 		 605 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  28.57 
 
 		 607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  27.38 
 
 		 605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  27.33 
 
 		 605 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  27.59 
 
 		 705 aa  137  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  25.53 
 
 		 616 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 619 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  25.22 
 
 		 627 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  25.44 
 
 		 628 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  28.48 
 
 		 596 aa  127  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  25.78 
 
 		 627 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  22.33 
 
 		 653 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  27.05 
 
 		 634 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  26.46 
 
 		 634 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  26.81 
 
 		 634 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  26.81 
 
 		 634 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  26.86 
 
 		 396 aa  114  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  26.86 
 
 		 394 aa  113  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  27.44 
 
 		 625 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  24.24 
 
 		 603 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  23.32 
 
 		 617 aa  110  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  24.64 
 
 		 677 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  24.1 
 
 		 603 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  24.04 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  25.28 
 
 		 607 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  26.78 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  25.55 
 
 		 595 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  28.77 
 
 		 573 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  24.31 
 
 		 603 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  24.89 
 
 		 658 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  24.01 
 
 		 634 aa  97.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  25.18 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  23.17 
 
 		 626 aa  96.3  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  23.62 
 
 		 634 aa  93.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  24.78 
 
 		 510 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  21.8 
 
 		 721 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  22.48 
 
 		 680 aa  87  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  27.92 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  27.76 
 
 		 576 aa  84.7  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  22.79 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  24.17 
 
 		 672 aa  80.5  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  25.55 
 
 		 672 aa  80.5  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  24.62 
 
 		 674 aa  78.2  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  22.49 
 
 		 604 aa  73.9  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  23.08 
 
 		 689 aa  70.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  23.08 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  23.08 
 
 		 689 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  27.21 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  25.78 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  25.78 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 678 aa  64.7  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  21.56 
 
 		 678 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  21.56 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  21.56 
 
 		 678 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  21.56 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  21.56 
 
 		 678 aa  62  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  21.56 
 
 		 678 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  22.44 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  22.44 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  21.56 
 
 		 678 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  22.44 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  22.44 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  21.26 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  22.44 
 
 		 680 aa  60.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  22.49 
 
 		 682 aa  60.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  19.77 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  20.93 
 
 		 704 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 400 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.51 
 
 		 676 aa  55.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  24.07 
 
 		 627 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 		 421 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.53 
 
 		 677 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 		 403 aa  51.2  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 401 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  26.63 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0302  hypothetical protein  22.78 
 
 		 705 aa  50.8  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  26.67 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 		 413 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 412 aa  44.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>