13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2836 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2167  hypothetical protein  55.19 
 
 		 674 aa  713    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0901646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2836  hypothetical protein  100 
 
 		 775 aa  1568    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1022  hypothetical protein  40.83 
 
 		 693 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.515866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0302  hypothetical protein  30.56 
 
 		 705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2152  hypothetical protein  42.2 
 
 		 451 aa  297  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2894  hypothetical protein  28.48 
 
 		 644 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.382794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  24.6 
 
 		 627 aa  81.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 643 aa  74.7  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  21.55 
 
 		 677 aa  55.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 		 413 aa  54.7  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 399 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4472  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  18.76 
 
 		 688 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0704928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 399 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>