17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2894 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2894  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1313    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.382794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0302  hypothetical protein  32.23 
 
 
705 aa  307  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0292766  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1022  hypothetical protein  35.5 
 
 
693 aa  286  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.515866  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2167  hypothetical protein  30.05 
 
 
674 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0901646  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2836  hypothetical protein  29.49 
 
 
775 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2152  hypothetical protein  33.43 
 
 
451 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
643 aa  80.5  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.39 
 
 
677 aa  61.6  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.02 
 
 
420 aa  57.4  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  23.55 
 
 
627 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 
451 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  22.51 
 
 
394 aa  47.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  25.27 
 
 
625 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  22.51 
 
 
396 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
413 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  22.77 
 
 
621 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 
356 aa  43.9  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>