72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3584 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 413 aa  816    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  43.13 
 
 		 420 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  42.98 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  39.95 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  42.75 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  40.98 
 
 		 415 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  41.45 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  43.47 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  38.86 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  40.85 
 
 		 401 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  37.53 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  42.44 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  40.91 
 
 		 399 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  41.47 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  40.46 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  40.72 
 
 		 398 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  42.74 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.81 
 
 		 391 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  40.47 
 
 		 378 aa  186  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  34.49 
 
 		 394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  35.07 
 
 		 400 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  36.52 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  36.52 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  34.76 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.26 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  32.84 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  33.91 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  32.55 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  33.62 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 643 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.72 
 
 		 676 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  29.6 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  32.22 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  27.89 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2167  hypothetical protein  31.31 
 
 		 674 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0901646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  38.1 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 651 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  30.53 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.21 
 
 		 677 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2836  hypothetical protein  27.63 
 
 		 775 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1022  hypothetical protein  27.88 
 
 		 693 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.515866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0110  Extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.08 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1291  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.08 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4472  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.94 
 
 		 688 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0704928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 625 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  22.08 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  25.64 
 
 		 621 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  25.22 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  20.72 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2721  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.37 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.368062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  30.91 
 
 		 604 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0302  hypothetical protein  27.76 
 
 		 705 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  26.61 
 
 		 604 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2894  hypothetical protein  29.14 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.382794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  28.89 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  27.03 
 
 		 603 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  27.69 
 
 		 605 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  24.82 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  23.02 
 
 		 604 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  29.13 
 
 		 602 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  26.4 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 604 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.89 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  24.05 
 
 		 596 aa  43.1  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  38.64 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>