More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0128 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  51.02 
 
 		 898 aa  650    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  55.28 
 
 		 832 aa  701    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  54.25 
 
 		 914 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  52.28 
 
 		 906 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.86 
 
 		 904 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.02 
 
 		 708 aa  670    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  54.65 
 
 		 864 aa  688    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  55.12 
 
 		 897 aa  707    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  54.72 
 
 		 859 aa  703    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  51.49 
 
 		 846 aa  677    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 697 aa  1433    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  50.71 
 
 		 977 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  41.98 
 
 		 703 aa  463  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  40.46 
 
 		 626 aa  437  1e-121  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  41.77 
 
 		 490 aa  351  3e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  31 
 
 		 853 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  33.94 
 
 		 752 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  37.88 
 
 		 808 aa  204  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  35.4 
 
 		 745 aa  203  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5027  DNA gyrase, A subunit  31.06 
 
 		 911 aa  203  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.0567458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  31.06 
 
 		 911 aa  203  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  31.73 
 
 		 796 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  32.65 
 
 		 805 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  33.48 
 
 		 750 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  31.19 
 
 		 835 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  30.98 
 
 		 806 aa  198  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  32.21 
 
 		 841 aa  197  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1202  DNA gyrase subunit A  32.68 
 
 		 900 aa  197  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  30.2 
 
 		 932 aa  197  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  30.02 
 
 		 923 aa  196  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  32.51 
 
 		 852 aa  197  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  37.88 
 
 		 767 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  34.27 
 
 		 834 aa  196  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  30.97 
 
 		 788 aa  196  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  31.74 
 
 		 831 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  32.09 
 
 		 793 aa  196  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  32.91 
 
 		 748 aa  195  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.04 
 
 		 828 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  31.99 
 
 		 744 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  31.6 
 
 		 848 aa  195  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  38.66 
 
 		 748 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  32.14 
 
 		 749 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  32.91 
 
 		 748 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  36.77 
 
 		 866 aa  194  6e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  30.86 
 
 		 913 aa  194  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  37.25 
 
 		 782 aa  193  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1620  DNA gyrase subunit A  33.7 
 
 		 881 aa  193  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  32.91 
 
 		 748 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  29.89 
 
 		 922 aa  193  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  30.77 
 
 		 824 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  29.34 
 
 		 899 aa  193  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  32.63 
 
 		 753 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  32.69 
 
 		 750 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  31.25 
 
 		 828 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  29.58 
 
 		 826 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  37.02 
 
 		 767 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  35.01 
 
 		 750 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  31.15 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  31.35 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  37.02 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  32.56 
 
 		 753 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  33.8 
 
 		 928 aa  192  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0958  DNA gyrase, A subunit  35.21 
 
 		 869 aa  192  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.687987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  39.24 
 
 		 751 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  32.87 
 
 		 883 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  29.7 
 
 		 934 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  35.19 
 
 		 749 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  30.14 
 
 		 911 aa  191  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  35.45 
 
 		 748 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  36.27 
 
 		 775 aa  191  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  32.8 
 
 		 754 aa  191  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  37.08 
 
 		 747 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  30.49 
 
 		 904 aa  191  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  33.24 
 
 		 825 aa  191  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  30.2 
 
 		 965 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  32.32 
 
 		 753 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  29.78 
 
 		 819 aa  190  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  34.92 
 
 		 927 aa  190  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  32.31 
 
 		 880 aa  190  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  33.15 
 
 		 869 aa  190  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  29.73 
 
 		 908 aa  190  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  29.8 
 
 		 807 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  34.07 
 
 		 904 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  31.15 
 
 		 809 aa  189  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  30.98 
 
 		 893 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  32.6 
 
 		 770 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  31.26 
 
 		 841 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1744  DNA gyrase subunit A  30.85 
 
 		 943 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  34.29 
 
 		 745 aa  189  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  32.6 
 
 		 775 aa  189  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  36.39 
 
 		 809 aa  190  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  38.72 
 
 		 748 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  30.22 
 
 		 743 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  37.36 
 
 		 777 aa  189  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  31.82 
 
 		 922 aa  189  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0858  DNA gyrase subunit A  30.8 
 
 		 898 aa  188  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.683478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  32.96 
 
 		 893 aa  189  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  30.92 
 
 		 811 aa  189  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  33.17 
 
 		 907 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  32.31 
 
 		 889 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>