More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1272 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2135  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.76 
 
 		 787 aa  768    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0106  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.99 
 
 		 781 aa  664    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 775 aa  1557    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.08 
 
 		 812 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  42.49 
 
 		 754 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  42.46 
 
 		 802 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  40.44 
 
 		 807 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  42.37 
 
 		 820 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  41.35 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 		 818 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.42 
 
 		 825 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  39.68 
 
 		 809 aa  530  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.67 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  41.95 
 
 		 814 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.67 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.06 
 
 		 808 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  40.67 
 
 		 821 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.69 
 
 		 899 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.67 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  37.96 
 
 		 818 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  39.57 
 
 		 796 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  39.06 
 
 		 830 aa  521  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.5 
 
 		 807 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  39.56 
 
 		 827 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  39.47 
 
 		 839 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  38.88 
 
 		 811 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 		 804 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  40.6 
 
 		 852 aa  515  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.34 
 
 		 839 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  39.76 
 
 		 804 aa  513  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  37.21 
 
 		 793 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  39.01 
 
 		 827 aa  509  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.27 
 
 		 816 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  40.18 
 
 		 853 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  38.55 
 
 		 901 aa  504  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  37.84 
 
 		 828 aa  502  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  38.74 
 
 		 838 aa  504  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  39.05 
 
 		 893 aa  500  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  40.72 
 
 		 788 aa  499  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  39.45 
 
 		 808 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  39.28 
 
 		 796 aa  501  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  41.72 
 
 		 747 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  39.97 
 
 		 833 aa  497  1e-139  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  39.34 
 
 		 841 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  39.2 
 
 		 836 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  38.07 
 
 		 875 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  42.34 
 
 		 748 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  39.12 
 
 		 835 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  40.89 
 
 		 816 aa  498  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  41.21 
 
 		 824 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  39.52 
 
 		 809 aa  497  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  39.77 
 
 		 812 aa  499  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  39.06 
 
 		 836 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  37.23 
 
 		 819 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  38.9 
 
 		 827 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  38.46 
 
 		 815 aa  496  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  38.14 
 
 		 832 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  38.35 
 
 		 826 aa  495  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  39.02 
 
 		 889 aa  495  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  37.45 
 
 		 870 aa  493  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  36.93 
 
 		 828 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  39.02 
 
 		 889 aa  495  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.04 
 
 		 809 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  37.04 
 
 		 828 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  37.7 
 
 		 827 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 869 aa  491  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  37.37 
 
 		 816 aa  489  1e-137  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  37.08 
 
 		 949 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  39.01 
 
 		 809 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  44.88 
 
 		 775 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  39.32 
 
 		 805 aa  491  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  38.81 
 
 		 806 aa  489  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  38.98 
 
 		 814 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  36.95 
 
 		 857 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  40.3 
 
 		 872 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  37.06 
 
 		 898 aa  488  1e-136  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  40.84 
 
 		 748 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  40.49 
 
 		 823 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  41.85 
 
 		 743 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  37.68 
 
 		 859 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  38.54 
 
 		 830 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  40.37 
 
 		 823 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  40.83 
 
 		 748 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  40.92 
 
 		 750 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  37.09 
 
 		 840 aa  486  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  39.5 
 
 		 745 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  40.05 
 
 		 744 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  39.01 
 
 		 809 aa  485  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  39.29 
 
 		 814 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  35.96 
 
 		 870 aa  485  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  37.19 
 
 		 848 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  45.69 
 
 		 777 aa  485  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  38.33 
 
 		 813 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>