More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1124 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  60.93 
 
 		 748 aa  932    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  69.66 
 
 		 758 aa  1116    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  73.7 
 
 		 770 aa  1165    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  57.69 
 
 		 767 aa  870    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  61.28 
 
 		 748 aa  943    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  65.58 
 
 		 748 aa  993    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  71.68 
 
 		 751 aa  1124    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  61.12 
 
 		 750 aa  962    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  63.2 
 
 		 749 aa  985    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  57.69 
 
 		 767 aa  870    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  71.68 
 
 		 751 aa  1129    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  57.65 
 
 		 743 aa  848    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  73.06 
 
 		 770 aa  1157    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  62.57 
 
 		 743 aa  942    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  58.01 
 
 		 750 aa  872    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  64.76 
 
 		 753 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  53.99 
 
 		 761 aa  820    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  56.32 
 
 		 775 aa  862    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  58.17 
 
 		 777 aa  884    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  62.48 
 
 		 752 aa  959    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  65.47 
 
 		 751 aa  1020    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  57.31 
 
 		 759 aa  855    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  62.48 
 
 		 748 aa  950    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  73.09 
 
 		 758 aa  1164    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  64.36 
 
 		 753 aa  998    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  62.67 
 
 		 749 aa  973    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  60.93 
 
 		 748 aa  941    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  55.28 
 
 		 782 aa  845    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  55.77 
 
 		 777 aa  859    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  65.02 
 
 		 745 aa  1009    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  61.17 
 
 		 744 aa  909    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 750 aa  1528    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  62.35 
 
 		 750 aa  961    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  61.07 
 
 		 748 aa  933    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  60.05 
 
 		 758 aa  887    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  73.58 
 
 		 775 aa  1162    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  50.82 
 
 		 754 aa  728    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  61.33 
 
 		 748 aa  934    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  57.03 
 
 		 767 aa  867    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  60.16 
 
 		 747 aa  900    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  68.94 
 
 		 745 aa  1105    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  64.23 
 
 		 753 aa  999    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  41.36 
 
 		 765 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  41.09 
 
 		 758 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  41.18 
 
 		 744 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  40.88 
 
 		 756 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  41.02 
 
 		 756 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  39.46 
 
 		 768 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  42.04 
 
 		 752 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3197  DNA topoisomerase IV subunit A  42.04 
 
 		 752 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  42.04 
 
 		 752 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  40.4 
 
 		 757 aa  542  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  42.04 
 
 		 752 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  40.49 
 
 		 747 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  42.04 
 
 		 752 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02891  DNA topoisomerase IV subunit A  41.9 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  40.22 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  40.22 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3310  DNA topoisomerase IV subunit A  42.25 
 
 		 752 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.31337  normal  0.0249309 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02841  hypothetical protein  41.9 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  41.23 
 
 		 776 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3456  DNA topoisomerase IV subunit A  41.9 
 
 		 752 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  40.3 
 
 		 752 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.82 
 
 		 753 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  40.22 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  40.16 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  40.29 
 
 		 757 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0581  DNA topoisomerase IV subunit A  39.68 
 
 		 757 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0662  DNA topoisomerase IV subunit A  39.68 
 
 		 757 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113034  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.18 
 
 		 758 aa  532  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  40.22 
 
 		 752 aa  535  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1982  DNA topoisomerase IV subunit A  42.96 
 
 		 750 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0348571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0276  DNA topoisomerase IV subunit A  39.68 
 
 		 757 aa  535  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  39.05 
 
 		 751 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3051  DNA topoisomerase IV subunit A  39.1 
 
 		 751 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2908  DNA topoisomerase IV subunit A  39.1 
 
 		 751 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2119  DNA topoisomerase IV subunit A  40.35 
 
 		 749 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454929  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01152  DNA topoisomerase IV subunit A  40.79 
 
 		 747 aa  529  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.335625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  39.05 
 
 		 753 aa  531  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  39.57 
 
 		 752 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  40.3 
 
 		 752 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  40.32 
 
 		 754 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  40.11 
 
 		 747 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  39.92 
 
 		 793 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  40.19 
 
 		 754 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  40.16 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  37.7 
 
 		 761 aa  524  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  39.62 
 
 		 749 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  41.76 
 
 		 773 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  39.53 
 
 		 781 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  40.66 
 
 		 791 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  41.37 
 
 		 780 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  38.43 
 
 		 756 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  40.24 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  42.65 
 
 		 772 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0598  DNA topoisomerase IV subunit A  38.38 
 
 		 748 aa  525  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  41.62 
 
 		 773 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  41.62 
 
 		 773 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0930  DNA topoisomerase IV subunit A  42.32 
 
 		 784 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1016  DNA topoisomerase IV subunit A  42.32 
 
 		 784 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>