More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1944 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  60.81 
 
 		 751 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  61.34 
 
 		 751 aa  959    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  64.47 
 
 		 750 aa  999    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  67.34 
 
 		 748 aa  1041    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  62.53 
 
 		 770 aa  974    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  62.1 
 
 		 758 aa  977    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  59.27 
 
 		 748 aa  911    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  66.08 
 
 		 748 aa  1026    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  61.67 
 
 		 758 aa  968    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 752 aa  1516    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  55.11 
 
 		 767 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  66.21 
 
 		 749 aa  1019    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  61.66 
 
 		 745 aa  962    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  54.6 
 
 		 743 aa  818    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  54.98 
 
 		 767 aa  835    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  66.76 
 
 		 748 aa  1023    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  54.98 
 
 		 767 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  55.48 
 
 		 759 aa  831    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  58.02 
 
 		 743 aa  875    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  56.14 
 
 		 777 aa  848    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  65.32 
 
 		 753 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  51.82 
 
 		 761 aa  758    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  63.05 
 
 		 770 aa  979    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  55.42 
 
 		 775 aa  836    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  64.82 
 
 		 751 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  64.78 
 
 		 753 aa  1017    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  66.26 
 
 		 753 aa  1037    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  57.8 
 
 		 744 aa  855    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  66.35 
 
 		 749 aa  1019    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  53.41 
 
 		 782 aa  813    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  52.64 
 
 		 777 aa  790    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  66.13 
 
 		 748 aa  1025    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  61.88 
 
 		 750 aa  960    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  62.4 
 
 		 775 aa  971    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  65.86 
 
 		 745 aa  1020    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  55.87 
 
 		 750 aa  826    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  55.74 
 
 		 758 aa  837    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  66.22 
 
 		 748 aa  1027    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  48.44 
 
 		 754 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  57.16 
 
 		 747 aa  871    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  78 
 
 		 750 aa  1219    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  66.08 
 
 		 748 aa  1026    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.86 
 
 		 758 aa  543  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  42.13 
 
 		 744 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  39.44 
 
 		 761 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  40.05 
 
 		 781 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  40.72 
 
 		 747 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  40.46 
 
 		 765 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.64 
 
 		 753 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  41.8 
 
 		 814 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  40.8 
 
 		 793 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  40.78 
 
 		 774 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  41.22 
 
 		 773 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  40.95 
 
 		 773 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  42.7 
 
 		 791 aa  522  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  40.47 
 
 		 774 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  40.69 
 
 		 773 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  41.73 
 
 		 776 aa  522  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  40.57 
 
 		 773 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  40.76 
 
 		 749 aa  522  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  40.57 
 
 		 773 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  41.94 
 
 		 752 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  40.44 
 
 		 773 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2194  DNA topoisomerase IV subunit A  39.24 
 
 		 762 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 		 780 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  40.8 
 
 		 773 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 		 750 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  40.77 
 
 		 780 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01152  DNA topoisomerase IV subunit A  40.19 
 
 		 747 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.335625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  39.25 
 
 		 768 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0705  DNA topoisomerase IV subunit A  39.65 
 
 		 749 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.965779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  40.71 
 
 		 772 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  39.86 
 
 		 753 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  40.81 
 
 		 772 aa  515  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  39.86 
 
 		 751 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  40.71 
 
 		 772 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  40.71 
 
 		 772 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0624  DNA topoisomerase IV subunit A  39.57 
 
 		 749 aa  510  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.166462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  40.71 
 
 		 772 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  40.71 
 
 		 772 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  40.71 
 
 		 772 aa  512  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  39.47 
 
 		 758 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0598  DNA topoisomerase IV subunit A  38.24 
 
 		 748 aa  510  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  40.4 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2632  DNA topoisomerase IV subunit A  42.47 
 
 		 774 aa  510  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  40.71 
 
 		 772 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  40.19 
 
 		 749 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0930  DNA topoisomerase IV subunit A  41.41 
 
 		 784 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0785421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  40.4 
 
 		 752 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1982  DNA topoisomerase IV subunit A  41.38 
 
 		 750 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0348571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  39.34 
 
 		 780 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  40.26 
 
 		 773 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  40.94 
 
 		 754 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  38.96 
 
 		 762 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  41.05 
 
 		 754 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  40.4 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  40.27 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1016  DNA topoisomerase IV subunit A  41.41 
 
 		 784 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969284  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  38.84 
 
 		 752 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0398  DNA topoisomerase IV subunit A  39 
 
 		 748 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.170842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>