More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3339 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  62.4 
 
 		 758 aa  966    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  57.12 
 
 		 743 aa  834    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  67.56 
 
 		 745 aa  1025    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  76.74 
 
 		 748 aa  1165    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  57.46 
 
 		 767 aa  862    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  59.7 
 
 		 748 aa  890    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  62.39 
 
 		 770 aa  954    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  60.61 
 
 		 751 aa  934    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  91.58 
 
 		 748 aa  1401    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  62.26 
 
 		 770 aa  954    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  62.26 
 
 		 775 aa  951    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  65 
 
 		 749 aa  991    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  57.33 
 
 		 767 aa  855    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  58.64 
 
 		 744 aa  847    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  60.61 
 
 		 751 aa  936    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  60.03 
 
 		 743 aa  880    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  64.3 
 
 		 753 aa  994    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  53.05 
 
 		 761 aa  780    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  76.31 
 
 		 748 aa  1159    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  57.58 
 
 		 775 aa  848    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  66.62 
 
 		 750 aa  1048    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  63.05 
 
 		 751 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  59.62 
 
 		 745 aa  936    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  57.82 
 
 		 777 aa  853    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  64.44 
 
 		 753 aa  996    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  64.19 
 
 		 749 aa  983    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  64.17 
 
 		 753 aa  988    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  54.99 
 
 		 782 aa  810    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  55.92 
 
 		 777 aa  818    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  62.48 
 
 		 750 aa  950    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  60.85 
 
 		 758 aa  945    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  67.66 
 
 		 752 aa  1040    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  54.55 
 
 		 759 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  78.45 
 
 		 748 aa  1191    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  56.17 
 
 		 750 aa  816    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  55.69 
 
 		 758 aa  825    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  50 
 
 		 754 aa  712    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  63.72 
 
 		 750 aa  974    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  57.33 
 
 		 767 aa  855    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  57.12 
 
 		 747 aa  850    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 748 aa  1510    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  76.47 
 
 		 748 aa  1162    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  43.08 
 
 		 781 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  43.37 
 
 		 773 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  41.4 
 
 		 774 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  40.78 
 
 		 776 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  42.28 
 
 		 772 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  42.28 
 
 		 772 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  42.94 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  42.55 
 
 		 772 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  42.28 
 
 		 772 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  43.06 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  43.06 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  43.06 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  42.28 
 
 		 772 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  42.28 
 
 		 772 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  42.65 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  41.01 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  42.76 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  42.28 
 
 		 772 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  42.8 
 
 		 773 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  42.28 
 
 		 772 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  39.6 
 
 		 761 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  41.86 
 
 		 780 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  42.08 
 
 		 814 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  41.49 
 
 		 791 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  40.66 
 
 		 780 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  39.71 
 
 		 765 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  40.03 
 
 		 768 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0930  DNA topoisomerase IV subunit A  42.16 
 
 		 784 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1016  DNA topoisomerase IV subunit A  42.02 
 
 		 784 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  39.12 
 
 		 793 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  41.43 
 
 		 780 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.19 
 
 		 753 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  40.53 
 
 		 750 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  39.42 
 
 		 756 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  40.11 
 
 		 758 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  38.73 
 
 		 756 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  39.21 
 
 		 756 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  40.81 
 
 		 752 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1201  DNA topoisomerase IV subunit A  40.86 
 
 		 784 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.955209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  40.56 
 
 		 749 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1850  DNA topoisomerase IV subunit A  38.95 
 
 		 805 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000934072  normal  0.0141672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5083  DNA topoisomerase IV subunit A  39.67 
 
 		 795 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79366  normal  0.0431885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  38.9 
 
 		 757 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  40.94 
 
 		 754 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  38.46 
 
 		 762 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  40.81 
 
 		 754 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  40.54 
 
 		 752 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  40.54 
 
 		 752 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3163  DNA topoisomerase IV subunit A  40.22 
 
 		 784 aa  505  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.960241  normal  0.258195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  39.38 
 
 		 752 aa  505  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  39.25 
 
 		 752 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2558  DNA topoisomerase IV subunit A  42.68 
 
 		 769 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  39.25 
 
 		 752 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0581  DNA topoisomerase IV subunit A  38.9 
 
 		 757 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  39.57 
 
 		 749 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  39.25 
 
 		 752 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  40.26 
 
 		 752 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0276  DNA topoisomerase IV subunit A  38.9 
 
 		 757 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>