More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0221 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  58.32 
 
 		 751 aa  884    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  60.24 
 
 		 745 aa  909    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  75.93 
 
 		 767 aa  1188    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  56.27 
 
 		 744 aa  833    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  55.01 
 
 		 743 aa  802    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  57.83 
 
 		 770 aa  870    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  57.57 
 
 		 775 aa  868    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  54.17 
 
 		 748 aa  813    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  59.12 
 
 		 749 aa  893    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  56.78 
 
 		 752 aa  848    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  56.56 
 
 		 750 aa  870    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  75.68 
 
 		 767 aa  1186    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  55.85 
 
 		 750 aa  857    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  75.55 
 
 		 767 aa  1180    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  60.99 
 
 		 743 aa  900    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  56.71 
 
 		 758 aa  863    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  57.37 
 
 		 753 aa  876    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  58.59 
 
 		 751 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  52.69 
 
 		 761 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  77.03 
 
 		 775 aa  1198    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  58.17 
 
 		 748 aa  858    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  55.73 
 
 		 750 aa  815    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  59.73 
 
 		 748 aa  918    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  58.46 
 
 		 751 aa  889    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  54.04 
 
 		 748 aa  812    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  57.37 
 
 		 753 aa  878    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  57.37 
 
 		 753 aa  877    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  58.59 
 
 		 749 aa  886    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  53.78 
 
 		 748 aa  801    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 777 aa  1572    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  72.68 
 
 		 782 aa  1164    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  53.97 
 
 		 777 aa  813    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  57.44 
 
 		 770 aa  867    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  53.28 
 
 		 759 aa  796    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  58.42 
 
 		 758 aa  890    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  58.17 
 
 		 750 aa  884    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  57.82 
 
 		 748 aa  853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  53.72 
 
 		 758 aa  811    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  54.3 
 
 		 748 aa  810    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  48.19 
 
 		 754 aa  702    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  55.72 
 
 		 745 aa  862    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  70.28 
 
 		 747 aa  1092    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  41.09 
 
 		 765 aa  545  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  40.96 
 
 		 752 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2194  DNA topoisomerase IV subunit A  38.81 
 
 		 762 aa  523  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  40.82 
 
 		 752 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  40.96 
 
 		 752 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.1 
 
 		 758 aa  525  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  40.1 
 
 		 749 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  39.22 
 
 		 756 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  40.82 
 
 		 754 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0551  DNA topoisomerase IV subunit A  39.58 
 
 		 755 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.243647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  40.05 
 
 		 758 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  39.18 
 
 		 768 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  40.46 
 
 		 747 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  41.83 
 
 		 814 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  39.06 
 
 		 761 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  40.82 
 
 		 754 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  41.18 
 
 		 744 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  39.08 
 
 		 756 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.45 
 
 		 753 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2119  DNA topoisomerase IV subunit A  39.34 
 
 		 749 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  41.09 
 
 		 752 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  40.66 
 
 		 750 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  40.69 
 
 		 752 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0598  DNA topoisomerase IV subunit A  38.5 
 
 		 748 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3051  DNA topoisomerase IV subunit A  39.07 
 
 		 751 aa  515  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1982  DNA topoisomerase IV subunit A  42.84 
 
 		 750 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0348571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  40.34 
 
 		 749 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3041  DNA topoisomerase IV subunit A  39.48 
 
 		 756 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3325  DNA topoisomerase IV subunit A  38.59 
 
 		 767 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.846721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  39.6 
 
 		 757 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4960  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.11 
 
 		 751 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  38.84 
 
 		 752 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2908  DNA topoisomerase IV subunit A  38.82 
 
 		 751 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1868  DNA topoisomerase IV subunit A  38.82 
 
 		 772 aa  510  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.198305  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  38.66 
 
 		 762 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  38.84 
 
 		 752 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  40 
 
 		 773 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  39.1 
 
 		 752 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0398  DNA topoisomerase IV subunit A  38.59 
 
 		 748 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.170842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2157  DNA topoisomerase IV subunit A  38.98 
 
 		 771 aa  511  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0732  DNA topoisomerase IV subunit A  38.82 
 
 		 758 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207588  decreased coverage  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  38.84 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  38.19 
 
 		 756 aa  508  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3897  DNA topoisomerase IV subunit A  38.56 
 
 		 758 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  38.63 
 
 		 751 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  41.21 
 
 		 773 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  39.55 
 
 		 747 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  41.18 
 
 		 773 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  38.63 
 
 		 753 aa  507  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3218  DNA topoisomerase IV subunit A  38.56 
 
 		 770 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000131393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  38.59 
 
 		 757 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  40.55 
 
 		 773 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0760  DNA topoisomerase IV subunit A  38.69 
 
 		 758 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000176508  hitchhiker  0.000384716 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  40.2 
 
 		 773 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  38.84 
 
 		 752 aa  509  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  40.55 
 
 		 773 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  38.78 
 
 		 752 aa  505  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  40.35 
 
 		 752 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>