More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2432 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  53.83 
 
 		 770 aa  818    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  52.95 
 
 		 745 aa  840    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  52.92 
 
 		 748 aa  791    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  56.63 
 
 		 749 aa  846    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  53.81 
 
 		 751 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  54.39 
 
 		 753 aa  823    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  71.06 
 
 		 767 aa  1135    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  53.94 
 
 		 752 aa  813    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  53.58 
 
 		 775 aa  814    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  52.79 
 
 		 748 aa  791    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  53.27 
 
 		 750 aa  824    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  57.53 
 
 		 743 aa  880    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  54.52 
 
 		 753 aa  822    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  49.87 
 
 		 761 aa  762    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  72.73 
 
 		 775 aa  1165    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  55.38 
 
 		 751 aa  829    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  53.62 
 
 		 744 aa  810    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  54.53 
 
 		 750 aa  818    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  54.07 
 
 		 751 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  53.61 
 
 		 743 aa  791    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  54.71 
 
 		 753 aa  823    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  56.3 
 
 		 749 aa  842    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  70.68 
 
 		 767 aa  1131    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  56.23 
 
 		 745 aa  852    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 782 aa  1601    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  51.38 
 
 		 777 aa  783    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  52.17 
 
 		 759 aa  782    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  55.28 
 
 		 750 aa  845    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  55.98 
 
 		 748 aa  874    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  53.54 
 
 		 748 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  52.4 
 
 		 748 aa  786    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  54.99 
 
 		 748 aa  810    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  53.93 
 
 		 770 aa  821    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  53.01 
 
 		 758 aa  799    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  53.77 
 
 		 758 aa  820    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  71.19 
 
 		 767 aa  1137    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  47.35 
 
 		 754 aa  684    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  54.42 
 
 		 758 aa  840    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  52.28 
 
 		 750 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  66.2 
 
 		 747 aa  1038    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  72.68 
 
 		 777 aa  1164    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  54.18 
 
 		 748 aa  813    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  41.4 
 
 		 765 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  40.67 
 
 		 756 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  41.47 
 
 		 781 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  40.49 
 
 		 814 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  39.19 
 
 		 768 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  39.48 
 
 		 780 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  39.5 
 
 		 761 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  39.74 
 
 		 747 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  39.48 
 
 		 780 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  40.39 
 
 		 756 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  39.79 
 
 		 774 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  39.82 
 
 		 750 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0598  DNA topoisomerase IV subunit A  40.57 
 
 		 748 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0930  DNA topoisomerase IV subunit A  41.84 
 
 		 784 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0785421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  39.33 
 
 		 769 aa  514  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2194  DNA topoisomerase IV subunit A  38.28 
 
 		 762 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  39.5 
 
 		 773 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2157  DNA topoisomerase IV subunit A  37.45 
 
 		 771 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  40.06 
 
 		 776 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1016  DNA topoisomerase IV subunit A  41.84 
 
 		 784 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  39.66 
 
 		 773 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  39.47 
 
 		 758 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  40.97 
 
 		 744 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  40.48 
 
 		 752 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1850  DNA topoisomerase IV subunit A  40.11 
 
 		 805 aa  511  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000934072  normal  0.0141672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  40.47 
 
 		 780 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  39.72 
 
 		 773 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  39.6 
 
 		 772 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  40.97 
 
 		 757 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  39.64 
 
 		 773 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3163  DNA topoisomerase IV subunit A  39.79 
 
 		 784 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.960241  normal  0.258195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  40.52 
 
 		 749 aa  509  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  39.34 
 
 		 753 aa  512  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  40 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004516  topoisomerase IV subunit A  38.92 
 
 		 761 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  39.45 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3897  DNA topoisomerase IV subunit A  38.04 
 
 		 758 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  39.45 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3051  DNA topoisomerase IV subunit A  38.36 
 
 		 751 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2908  DNA topoisomerase IV subunit A  38.49 
 
 		 751 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1868  DNA topoisomerase IV subunit A  36.95 
 
 		 772 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.198305  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  39.45 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0775  DNA topoisomerase IV subunit A  37.5 
 
 		 758 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0849191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  39.45 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  38.99 
 
 		 793 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  39.45 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  39.65 
 
 		 773 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  39.45 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  40.06 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  38.68 
 
 		 752 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2558  DNA topoisomerase IV subunit A  39.11 
 
 		 769 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  39.65 
 
 		 773 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  39.45 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  37.99 
 
 		 758 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  38.33 
 
 		 752 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  40.06 
 
 		 752 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  38.33 
 
 		 752 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5083  DNA topoisomerase IV subunit A  39.13 
 
 		 795 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79366  normal  0.0431885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>