More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0901 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  66.89 
 
 		 773 aa  1000    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0399  DNA topoisomerase IV subunit A  60.81 
 
 		 785 aa  942    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526088  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1693  DNA topoisomerase IV subunit A  53.84 
 
 		 801 aa  716    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  68.13 
 
 		 781 aa  1055    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1342  DNA topoisomerase IV subunit A  62.23 
 
 		 785 aa  951    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119346  normal  0.375722 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  66.58 
 
 		 772 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  66.45 
 
 		 772 aa  999    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  66.89 
 
 		 773 aa  998    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1850  DNA topoisomerase IV subunit A  55.12 
 
 		 805 aa  768    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000934072  normal  0.0141672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  68.73 
 
 		 780 aa  1046    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  66.62 
 
 		 773 aa  995    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  66.58 
 
 		 772 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  66.58 
 
 		 772 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5083  DNA topoisomerase IV subunit A  61.05 
 
 		 795 aa  931    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79366  normal  0.0431885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1016  DNA topoisomerase IV subunit A  61.97 
 
 		 784 aa  950    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  66.76 
 
 		 773 aa  996    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1201  DNA topoisomerase IV subunit A  62.43 
 
 		 784 aa  956    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.955209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  66.45 
 
 		 772 aa  1001    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3425  DNA topoisomerase IV subunit A  60.23 
 
 		 798 aa  926    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2558  DNA topoisomerase IV subunit A  63.64 
 
 		 769 aa  972    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  92.43 
 
 		 791 aa  1482    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  66.45 
 
 		 772 aa  999    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2641  DNA topoisomerase IV subunit A  61.85 
 
 		 796 aa  931    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.122568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  56.23 
 
 		 814 aa  824    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3163  DNA topoisomerase IV subunit A  63.99 
 
 		 784 aa  967    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.960241  normal  0.258195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  65.69 
 
 		 774 aa  990    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  64.62 
 
 		 774 aa  976    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  67.57 
 
 		 780 aa  1064    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  67.31 
 
 		 780 aa  1060    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  68.91 
 
 		 776 aa  1061    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  66.53 
 
 		 773 aa  1003    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 793 aa  1600    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  67.02 
 
 		 773 aa  1000    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  66.62 
 
 		 773 aa  996    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0930  DNA topoisomerase IV subunit A  61.97 
 
 		 784 aa  949    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0785421  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2028  DNA topoisomerase IV subunit A  53.84 
 
 		 801 aa  716    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  67.02 
 
 		 773 aa  1000    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  66.45 
 
 		 772 aa  999    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2632  DNA topoisomerase IV subunit A  62.99 
 
 		 774 aa  971    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  66.45 
 
 		 772 aa  999    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0760  DNA topoisomerase IV subunit A  44.4 
 
 		 758 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000176508  hitchhiker  0.000384716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0732  DNA topoisomerase IV subunit A  44.4 
 
 		 758 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207588  decreased coverage  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3229  DNA topoisomerase IV subunit A  44.27 
 
 		 758 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308276  hitchhiker  0.00000104584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0775  DNA topoisomerase IV subunit A  44.01 
 
 		 758 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0849191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3041  DNA topoisomerase IV subunit A  44.14 
 
 		 756 aa  621  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3897  DNA topoisomerase IV subunit A  43.87 
 
 		 758 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3571  DNA topoisomerase IV subunit A  43.74 
 
 		 758 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0073811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0788  DNA topoisomerase IV subunit A  43.74 
 
 		 758 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0820  DNA topoisomerase IV subunit A  43.74 
 
 		 758 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0813  DNA topoisomerase IV subunit A  43.74 
 
 		 758 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00825768  unclonable  0.00000000000743821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3325  DNA topoisomerase IV subunit A  43.76 
 
 		 767 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.846721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0551  DNA topoisomerase IV subunit A  43.23 
 
 		 755 aa  611  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.243647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  42.72 
 
 		 765 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2119  DNA topoisomerase IV subunit A  44.53 
 
 		 749 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3218  DNA topoisomerase IV subunit A  43.04 
 
 		 770 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000131393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  43.59 
 
 		 768 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  45.03 
 
 		 753 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02891  DNA topoisomerase IV subunit A  43.61 
 
 		 752 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  43.61 
 
 		 752 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  43.61 
 
 		 752 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  44.91 
 
 		 769 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3197  DNA topoisomerase IV subunit A  43.61 
 
 		 752 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3456  DNA topoisomerase IV subunit A  43.61 
 
 		 752 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  43.61 
 
 		 752 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02841  hypothetical protein  43.61 
 
 		 752 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  43.61 
 
 		 752 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  43.12 
 
 		 756 aa  599  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  42.99 
 
 		 756 aa  601  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4188  DNA topoisomerase IV subunit A  42.31 
 
 		 758 aa  601  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0781  DNA topoisomerase IV subunit A  42.42 
 
 		 757 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.255419  hitchhiker  0.00000939983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  43.44 
 
 		 754 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3051  DNA topoisomerase IV subunit A  43.73 
 
 		 751 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2908  DNA topoisomerase IV subunit A  43.87 
 
 		 751 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  43.29 
 
 		 747 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3310  DNA topoisomerase IV subunit A  43.48 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.31337  normal  0.0249309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  43.29 
 
 		 754 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  43.21 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  43.98 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  43.87 
 
 		 747 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  44.8 
 
 		 749 aa  598  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  43.21 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  43.21 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  43.21 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  43.21 
 
 		 752 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  43.89 
 
 		 752 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  44.88 
 
 		 744 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4960  DNA topoisomerase IV, A subunit  43.31 
 
 		 751 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00492  DNA topoisomerase IV subunit A  43.44 
 
 		 761 aa  595  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  43.03 
 
 		 758 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  44.3 
 
 		 751 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  43.89 
 
 		 752 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0705  DNA topoisomerase IV subunit A  43.7 
 
 		 749 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.965779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  44.3 
 
 		 753 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  43.63 
 
 		 752 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0624  DNA topoisomerase IV subunit A  43.77 
 
 		 749 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.166462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  43.02 
 
 		 756 aa  588  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3556  DNA topoisomerase IV subunit A  42.29 
 
 		 755 aa  591  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  43.87 
 
 		 752 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  42.56 
 
 		 752 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  42.99 
 
 		 749 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>