More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2931 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02891  DNA topoisomerase IV subunit A  45.65 
 
 
752 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  45.65 
 
 
752 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  59.04 
 
 
772 aa  861    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  47 
 
 
757 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  59.17 
 
 
772 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  55.87 
 
 
793 aa  847    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  60.88 
 
 
781 aa  882    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  49.21 
 
 
756 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1693  DNA topoisomerase IV subunit A  55.54 
 
 
801 aa  749    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182057  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  45.65 
 
 
752 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  59.04 
 
 
772 aa  861    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  45.65 
 
 
752 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1850  DNA topoisomerase IV subunit A  56.13 
 
 
805 aa  836    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000934072  normal  0.0141672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  59.46 
 
 
780 aa  855    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3456  DNA topoisomerase IV subunit A  45.52 
 
 
752 aa  643    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  59.87 
 
 
774 aa  866    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  59.17 
 
 
772 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1342  DNA topoisomerase IV subunit A  55.97 
 
 
785 aa  810    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119346  normal  0.375722 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  59.04 
 
 
772 aa  861    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  60.67 
 
 
773 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1016  DNA topoisomerase IV subunit A  55.92 
 
 
784 aa  821    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969284  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0399  DNA topoisomerase IV subunit A  55.72 
 
 
785 aa  820    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526088  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  59.17 
 
 
772 aa  867    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2558  DNA topoisomerase IV subunit A  58.94 
 
 
769 aa  861    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2632  DNA topoisomerase IV subunit A  57.7 
 
 
774 aa  852    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2641  DNA topoisomerase IV subunit A  55.01 
 
 
796 aa  784    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.122568  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2028  DNA topoisomerase IV subunit A  55.54 
 
 
801 aa  749    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3163  DNA topoisomerase IV subunit A  58.36 
 
 
784 aa  842    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.960241  normal  0.258195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  45.65 
 
 
752 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  60.53 
 
 
774 aa  881    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
814 aa  1642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5083  DNA topoisomerase IV subunit A  54.45 
 
 
795 aa  819    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79366  normal  0.0431885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  60.67 
 
 
773 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  60.08 
 
 
776 aa  870    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  57.29 
 
 
791 aa  847    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  60.24 
 
 
773 aa  865    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  60.64 
 
 
773 aa  865    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3310  DNA topoisomerase IV subunit A  45.38 
 
 
752 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.31337  normal  0.0249309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  48.78 
 
 
756 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  59.13 
 
 
780 aa  879    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3197  DNA topoisomerase IV subunit A  45.65 
 
 
752 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0930  DNA topoisomerase IV subunit A  55.92 
 
 
784 aa  820    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0785421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3425  DNA topoisomerase IV subunit A  53.61 
 
 
798 aa  792    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  59.25 
 
 
780 aa  881    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  59.69 
 
 
773 aa  874    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  60.51 
 
 
773 aa  865    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  60.67 
 
 
773 aa  868    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  59.17 
 
 
772 aa  862    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1201  DNA topoisomerase IV subunit A  54.5 
 
 
784 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.955209 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  59.04 
 
 
772 aa  861    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  60.64 
 
 
773 aa  865    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2119  DNA topoisomerase IV subunit A  48.91 
 
 
749 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02841  hypothetical protein  45.65 
 
 
752 aa  644    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440979  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  45.65 
 
 
752 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  46.96 
 
 
744 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  48.16 
 
 
758 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  45.52 
 
 
752 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  45.52 
 
 
752 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  48.52 
 
 
757 aa  634  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  45.44 
 
 
752 aa  635  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  45.65 
 
 
752 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  45.38 
 
 
752 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0276  DNA topoisomerase IV subunit A  46.25 
 
 
757 aa  626  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  46.53 
 
 
768 aa  627  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  48.85 
 
 
750 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0662  DNA topoisomerase IV subunit A  46.25 
 
 
757 aa  626  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113034  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0581  DNA topoisomerase IV subunit A  46.25 
 
 
757 aa  626  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  44.11 
 
 
765 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  46.45 
 
 
753 aa  622  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  44.99 
 
 
752 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  48.66 
 
 
758 aa  618  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004516  topoisomerase IV subunit A  47.3 
 
 
761 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  45.2 
 
 
752 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  45.47 
 
 
749 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  45.26 
 
 
752 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0598  DNA topoisomerase IV subunit A  43.93 
 
 
748 aa  614  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  44.8 
 
 
754 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3041  DNA topoisomerase IV subunit A  45.14 
 
 
756 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  44.67 
 
 
752 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  44.52 
 
 
769 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  44.25 
 
 
753 aa  611  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  44.25 
 
 
751 aa  610  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  44.67 
 
 
752 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4960  DNA topoisomerase IV, A subunit  45.08 
 
 
751 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  44.04 
 
 
756 aa  607  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  44.79 
 
 
747 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0384  DNA topoisomerase IV subunit A  45.58 
 
 
742 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.4801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  44.53 
 
 
754 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01152  DNA topoisomerase IV subunit A  47.59 
 
 
747 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.335625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  44.85 
 
 
762 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  45.54 
 
 
749 aa  608  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  44.13 
 
 
761 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0503  DNA topoisomerase IV subunit A  43.87 
 
 
754 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668096  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0864  DNA topoisomerase IV subunit A  45.99 
 
 
759 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0781  DNA topoisomerase IV subunit A  44.34 
 
 
757 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.255419  hitchhiker  0.00000939983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0775  DNA topoisomerase IV subunit A  44.21 
 
 
758 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0849191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  47.01 
 
 
747 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00492  DNA topoisomerase IV subunit A  46.57 
 
 
761 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0820  DNA topoisomerase IV subunit A  44.28 
 
 
758 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0813  DNA topoisomerase IV subunit A  44.28 
 
 
758 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00825768  unclonable  0.00000000000743821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>