More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2123 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  86.53 
 
 		 772 aa  1332    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  72.42 
 
 		 781 aa  1113    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  86.53 
 
 		 772 aa  1332    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  86.66 
 
 		 772 aa  1333    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1850  DNA topoisomerase IV subunit A  55.67 
 
 		 805 aa  829    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000934072  normal  0.0141672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  71.47 
 
 		 780 aa  1081    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3425  DNA topoisomerase IV subunit A  62.03 
 
 		 798 aa  962    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 773 aa  1570    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  86.66 
 
 		 772 aa  1333    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  84.72 
 
 		 773 aa  1306    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2028  DNA topoisomerase IV subunit A  53.03 
 
 		 801 aa  714    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0399  DNA topoisomerase IV subunit A  65.08 
 
 		 785 aa  1006    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526088  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  86.53 
 
 		 772 aa  1332    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  86.66 
 
 		 772 aa  1334    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  84.46 
 
 		 773 aa  1302    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  86.66 
 
 		 772 aa  1334    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  66.53 
 
 		 793 aa  1026    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2558  DNA topoisomerase IV subunit A  67.86 
 
 		 769 aa  1028    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5083  DNA topoisomerase IV subunit A  63.67 
 
 		 795 aa  984    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79366  normal  0.0431885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  85.1 
 
 		 773 aa  1311    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  85.23 
 
 		 773 aa  1312    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2641  DNA topoisomerase IV subunit A  64.77 
 
 		 796 aa  973    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.122568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3163  DNA topoisomerase IV subunit A  67.76 
 
 		 784 aa  1023    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.960241  normal  0.258195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  71.99 
 
 		 780 aa  1121    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  87.55 
 
 		 774 aa  1360    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  72.25 
 
 		 780 aa  1125    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  87.16 
 
 		 774 aa  1352    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  70.88 
 
 		 776 aa  1103    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  60.7 
 
 		 814 aa  882    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  85.1 
 
 		 773 aa  1312    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2632  DNA topoisomerase IV subunit A  67.81 
 
 		 774 aa  1026    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1693  DNA topoisomerase IV subunit A  53.03 
 
 		 801 aa  714    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1016  DNA topoisomerase IV subunit A  65.73 
 
 		 784 aa  1004    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  67.87 
 
 		 791 aa  1037    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  84.59 
 
 		 773 aa  1303    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1201  DNA topoisomerase IV subunit A  65.22 
 
 		 784 aa  1007    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.955209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  85.1 
 
 		 773 aa  1312    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1342  DNA topoisomerase IV subunit A  66.5 
 
 		 785 aa  1000    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119346  normal  0.375722 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  86.53 
 
 		 772 aa  1332    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0930  DNA topoisomerase IV subunit A  65.73 
 
 		 784 aa  1002    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0785421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  48.24 
 
 		 752 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  48.24 
 
 		 752 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  48.24 
 
 		 752 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3197  DNA topoisomerase IV subunit A  48.24 
 
 		 752 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  48.24 
 
 		 752 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3041  DNA topoisomerase IV subunit A  48.32 
 
 		 756 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02891  DNA topoisomerase IV subunit A  48.24 
 
 		 752 aa  628  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02841  hypothetical protein  48.24 
 
 		 752 aa  628  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3456  DNA topoisomerase IV subunit A  48.24 
 
 		 752 aa  628  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  47.95 
 
 		 756 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  48.32 
 
 		 768 aa  627  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  47.65 
 
 		 752 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3310  DNA topoisomerase IV subunit A  48.09 
 
 		 752 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.31337  normal  0.0249309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  48.39 
 
 		 758 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  46.54 
 
 		 750 aa  619  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  47.65 
 
 		 752 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  47.51 
 
 		 752 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  47.51 
 
 		 752 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  47.51 
 
 		 752 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  47.21 
 
 		 756 aa  621  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  46.92 
 
 		 752 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0551  DNA topoisomerase IV subunit A  47.26 
 
 		 755 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.243647 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  45.81 
 
 		 753 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  45.51 
 
 		 749 aa  616  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  48.53 
 
 		 757 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  46.92 
 
 		 744 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3897  DNA topoisomerase IV subunit A  47.14 
 
 		 758 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  43.57 
 
 		 765 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0775  DNA topoisomerase IV subunit A  47.3 
 
 		 758 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0849191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0788  DNA topoisomerase IV subunit A  46.72 
 
 		 758 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  44.82 
 
 		 752 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  48.32 
 
 		 752 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0813  DNA topoisomerase IV subunit A  46.72 
 
 		 758 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00825768  unclonable  0.00000000000743821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0820  DNA topoisomerase IV subunit A  46.72 
 
 		 758 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3571  DNA topoisomerase IV subunit A  46.72 
 
 		 758 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0073811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  47.65 
 
 		 757 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2119  DNA topoisomerase IV subunit A  47.02 
 
 		 749 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454929  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0760  DNA topoisomerase IV subunit A  47.45 
 
 		 758 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000176508  hitchhiker  0.000384716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  44.71 
 
 		 754 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0732  DNA topoisomerase IV subunit A  47 
 
 		 758 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207588  decreased coverage  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  44.82 
 
 		 752 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  47.07 
 
 		 769 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  44.55 
 
 		 752 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  43.6 
 
 		 747 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00492  DNA topoisomerase IV subunit A  46.39 
 
 		 761 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0398  DNA topoisomerase IV subunit A  45.43 
 
 		 748 aa  605  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.170842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  44.71 
 
 		 754 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0509  DNA topoisomerase IV subunit A  44.24 
 
 		 770 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0256564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3229  DNA topoisomerase IV subunit A  47.15 
 
 		 758 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308276  hitchhiker  0.00000104584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  44.96 
 
 		 758 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01152  DNA topoisomerase IV subunit A  44.91 
 
 		 747 aa  605  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.335625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4960  DNA topoisomerase IV, A subunit  44.07 
 
 		 751 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0662  DNA topoisomerase IV subunit A  46.19 
 
 		 757 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0276  DNA topoisomerase IV subunit A  46.19 
 
 		 757 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  44.47 
 
 		 752 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0581  DNA topoisomerase IV subunit A  46.19 
 
 		 757 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  44.64 
 
 		 749 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  43.27 
 
 		 761 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  45.83 
 
 		 747 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3325  DNA topoisomerase IV subunit A  44.5 
 
 		 767 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.846721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>