More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2539 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  62.26 
 
 
748 aa  971    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  56.85 
 
 
767 aa  892    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  62.08 
 
 
750 aa  986    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  96.49 
 
 
770 aa  1504    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  54.02 
 
 
759 aa  833    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
770 aa  1569    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  57.44 
 
 
777 aa  881    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  56.73 
 
 
767 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  55.63 
 
 
750 aa  860    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  63.51 
 
 
749 aa  1004    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  56.73 
 
 
767 aa  883    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  67.57 
 
 
751 aa  1084    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  59.92 
 
 
743 aa  927    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  96.23 
 
 
775 aa  1498    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  62.08 
 
 
748 aa  976    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  63.47 
 
 
753 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  53.33 
 
 
761 aa  798    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  57.35 
 
 
775 aa  876    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  59.01 
 
 
748 aa  924    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  63.34 
 
 
753 aa  1010    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  63.12 
 
 
751 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  70.52 
 
 
758 aa  1147    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  63.47 
 
 
753 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  63.51 
 
 
749 aa  1004    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  53.93 
 
 
782 aa  835    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  53.19 
 
 
777 aa  833    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  73.06 
 
 
750 aa  1177    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  58.51 
 
 
744 aa  911    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  70.52 
 
 
758 aa  1131    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  59.74 
 
 
748 aa  944    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  57.85 
 
 
743 aa  875    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  57.4 
 
 
758 aa  871    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  58.88 
 
 
748 aa  924    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  48.95 
 
 
754 aa  725    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  64.81 
 
 
745 aa  1029    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  56.94 
 
 
747 aa  879    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  62.13 
 
 
748 aa  973    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  63.75 
 
 
752 aa  994    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  59.14 
 
 
748 aa  925    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  60.62 
 
 
750 aa  968    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  67.44 
 
 
751 aa  1084    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  72.73 
 
 
745 aa  1158    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  39.95 
 
 
765 aa  548  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  39.58 
 
 
758 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  38.29 
 
 
768 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  39.87 
 
 
753 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  38.93 
 
 
747 aa  526  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  40.08 
 
 
744 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  40.93 
 
 
814 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  38.71 
 
 
758 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  37.53 
 
 
753 aa  522  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  37.4 
 
 
751 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  41.65 
 
 
773 aa  522  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  40.22 
 
 
793 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  39.92 
 
 
791 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  40.86 
 
 
773 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  37.53 
 
 
761 aa  512  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  41.23 
 
 
773 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  37.98 
 
 
756 aa  515  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  37.77 
 
 
757 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  41.67 
 
 
772 aa  515  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  41.37 
 
 
773 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2119  DNA topoisomerase IV subunit A  38.85 
 
 
749 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  38.02 
 
 
756 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  37.16 
 
 
769 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
772 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  37.4 
 
 
756 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  40.95 
 
 
773 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  38.11 
 
 
750 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  40.95 
 
 
773 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  39.11 
 
 
749 aa  509  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
772 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  40.95 
 
 
773 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  38.05 
 
 
749 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
772 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01152  DNA topoisomerase IV subunit A  39.06 
 
 
747 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.335625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
772 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
772 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  37.93 
 
 
781 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  38.31 
 
 
754 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
772 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  40.91 
 
 
774 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  38.7 
 
 
776 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  37.69 
 
 
752 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  38.41 
 
 
754 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
772 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0276  DNA topoisomerase IV subunit A  37.79 
 
 
757 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0581  DNA topoisomerase IV subunit A  37.79 
 
 
757 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  40.22 
 
 
774 aa  505  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  37.94 
 
 
780 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  37.84 
 
 
747 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  37.89 
 
 
752 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0662  DNA topoisomerase IV subunit A  37.79 
 
 
757 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  38.05 
 
 
757 aa  505  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  37.94 
 
 
752 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  37.76 
 
 
762 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  37.63 
 
 
752 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  40.81 
 
 
773 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0598  DNA topoisomerase IV subunit A  36.9 
 
 
748 aa  501  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  37.76 
 
 
752 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>