More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2978 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  55.51 
 
 		 767 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  56.91 
 
 		 744 aa  847    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  62.5 
 
 		 751 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  63.47 
 
 		 770 aa  990    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  55.91 
 
 		 767 aa  838    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  55.76 
 
 		 759 aa  831    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  64.17 
 
 		 748 aa  988    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  56.09 
 
 		 750 aa  835    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  61.33 
 
 		 748 aa  958    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  86.04 
 
 		 749 aa  1338    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  64.71 
 
 		 750 aa  1011    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  55.56 
 
 		 743 aa  803    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  55.38 
 
 		 767 aa  833    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  63.28 
 
 		 748 aa  974    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  62.77 
 
 		 751 aa  957    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  61.74 
 
 		 758 aa  954    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  57.01 
 
 		 743 aa  873    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  63.21 
 
 		 775 aa  985    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  94.02 
 
 		 753 aa  1457    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  51.59 
 
 		 761 aa  760    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  56.36 
 
 		 775 aa  855    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  57.37 
 
 		 777 aa  878    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  91.49 
 
 		 751 aa  1424    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  62.67 
 
 		 748 aa  956    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  61.6 
 
 		 748 aa  953    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  95.08 
 
 		 753 aa  1470    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  86.04 
 
 		 749 aa  1338    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  82.85 
 
 		 750 aa  1295    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  54.39 
 
 		 782 aa  823    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  53.33 
 
 		 777 aa  811    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  63.34 
 
 		 770 aa  994    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 753 aa  1531    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  67.38 
 
 		 745 aa  1061    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  64.23 
 
 		 750 aa  999    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  61.14 
 
 		 745 aa  957    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  63.28 
 
 		 748 aa  969    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  61.6 
 
 		 748 aa  961    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  56.28 
 
 		 758 aa  860    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  65.48 
 
 		 752 aa  1016    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  47.09 
 
 		 754 aa  677    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  63.06 
 
 		 758 aa  979    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  55.3 
 
 		 747 aa  847    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  41.72 
 
 		 781 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  41.18 
 
 		 765 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  41 
 
 		 756 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  42.07 
 
 		 776 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  41.23 
 
 		 793 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  42.76 
 
 		 780 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  39.14 
 
 		 761 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  40.62 
 
 		 756 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  40.6 
 
 		 780 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  40.08 
 
 		 758 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  40.18 
 
 		 791 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  40.14 
 
 		 757 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  39.66 
 
 		 750 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  41.51 
 
 		 749 aa  515  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  40.34 
 
 		 780 aa  515  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  39.71 
 
 		 757 aa  512  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  42.49 
 
 		 773 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  42.45 
 
 		 773 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  42.49 
 
 		 773 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  42.49 
 
 		 773 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02891  DNA topoisomerase IV subunit A  41.74 
 
 		 752 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.74 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  41.74 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 		 744 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  41.89 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  42.84 
 
 		 773 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  42.84 
 
 		 773 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3197  DNA topoisomerase IV subunit A  41.74 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  41.59 
 
 		 752 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  41.59 
 
 		 752 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02841  hypothetical protein  41.74 
 
 		 752 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  42.98 
 
 		 773 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  41.74 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  41.74 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3456  DNA topoisomerase IV subunit A  41.74 
 
 		 752 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  39.6 
 
 		 768 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3310  DNA topoisomerase IV subunit A  41.74 
 
 		 752 aa  505  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.31337  normal  0.0249309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  38.5 
 
 		 762 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  41.59 
 
 		 752 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  43 
 
 		 772 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  41.51 
 
 		 774 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  41.59 
 
 		 752 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  41.62 
 
 		 752 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  43 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  43 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  39.41 
 
 		 751 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  43 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  39.41 
 
 		 753 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  43 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  43 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1982  DNA topoisomerase IV subunit A  42.48 
 
 		 750 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0348571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004516  topoisomerase IV subunit A  40.06 
 
 		 761 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  43 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  43 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  38.26 
 
 		 756 aa  502  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0662  DNA topoisomerase IV subunit A  41.96 
 
 		 757 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113034  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0581  DNA topoisomerase IV subunit A  41.96 
 
 		 757 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0276  DNA topoisomerase IV subunit A  41.96 
 
 		 757 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>