More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2793 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  53.33 
 
 		 770 aa  783    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  54.02 
 
 		 767 aa  813    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  53.05 
 
 		 748 aa  780    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  68.3 
 
 		 750 aa  1049    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  53.2 
 
 		 770 aa  783    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  52.77 
 
 		 748 aa  765    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  54.15 
 
 		 767 aa  815    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  51.82 
 
 		 752 aa  759    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  51.92 
 
 		 748 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  49.08 
 
 		 759 aa  710    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  53.7 
 
 		 745 aa  805    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  52.27 
 
 		 749 aa  761    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  51.79 
 
 		 748 aa  756    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  54.02 
 
 		 767 aa  814    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  50.92 
 
 		 750 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  54.38 
 
 		 748 aa  795    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  57.82 
 
 		 743 aa  846    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  57.27 
 
 		 745 aa  837    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  51.38 
 
 		 753 aa  766    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 761 aa  1536    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  51.92 
 
 		 748 aa  757    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  53.48 
 
 		 775 aa  818    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  52.69 
 
 		 777 aa  791    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  52.31 
 
 		 751 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  51.48 
 
 		 750 aa  751    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  51.59 
 
 		 753 aa  760    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  51.51 
 
 		 753 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  52.93 
 
 		 749 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  49.87 
 
 		 782 aa  762    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  71.35 
 
 		 777 aa  1122    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  52.69 
 
 		 758 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  53.99 
 
 		 750 aa  820    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  55.11 
 
 		 744 aa  826    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  52.16 
 
 		 758 aa  769    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  51.4 
 
 		 751 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  55.01 
 
 		 758 aa  801    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  51.53 
 
 		 751 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  52.94 
 
 		 775 aa  778    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  46.02 
 
 		 754 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  55.86 
 
 		 747 aa  840    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  53.07 
 
 		 743 aa  745    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  56.82 
 
 		 748 aa  822    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  40.7 
 
 		 765 aa  535  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  42.98 
 
 		 768 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  42 
 
 		 773 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  39.72 
 
 		 753 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  41.45 
 
 		 773 aa  525  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  41.59 
 
 		 773 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  41.59 
 
 		 773 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  41.59 
 
 		 773 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  40.66 
 
 		 793 aa  525  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  40.72 
 
 		 744 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  40.48 
 
 		 749 aa  522  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  41.59 
 
 		 773 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  40.03 
 
 		 791 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  41.45 
 
 		 773 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  38.65 
 
 		 761 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  39.39 
 
 		 747 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  41.31 
 
 		 774 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  39.64 
 
 		 762 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0760  DNA topoisomerase IV subunit A  39.87 
 
 		 758 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000176508  hitchhiker  0.000384716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  38.93 
 
 		 758 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  38.9 
 
 		 757 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  39.77 
 
 		 756 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004516  topoisomerase IV subunit A  41.31 
 
 		 761 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.03 
 
 		 758 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  39.63 
 
 		 756 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0384  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 		 742 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.4801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  41.58 
 
 		 774 aa  515  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  40.62 
 
 		 752 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  39.13 
 
 		 757 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3229  DNA topoisomerase IV subunit A  39.74 
 
 		 758 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308276  hitchhiker  0.00000104584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0732  DNA topoisomerase IV subunit A  39.74 
 
 		 758 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207588  decreased coverage  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  41.67 
 
 		 772 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02891  DNA topoisomerase IV subunit A  39.89 
 
 		 752 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  39.89 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  40.35 
 
 		 752 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  40.36 
 
 		 752 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3456  DNA topoisomerase IV subunit A  39.89 
 
 		 752 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  41.67 
 
 		 772 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  41.67 
 
 		 772 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  39.89 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  40.36 
 
 		 752 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3197  DNA topoisomerase IV subunit A  39.89 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  41.67 
 
 		 772 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  41.67 
 
 		 772 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  41.67 
 
 		 772 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0624  DNA topoisomerase IV subunit A  40.23 
 
 		 749 aa  510  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.166462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0775  DNA topoisomerase IV subunit A  38.95 
 
 		 758 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0849191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  40.36 
 
 		 752 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  40.51 
 
 		 776 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  39.89 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0509  DNA topoisomerase IV subunit A  38.53 
 
 		 770 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0256564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  41.67 
 
 		 772 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  40.36 
 
 		 752 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  40.43 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02841  hypothetical protein  39.89 
 
 		 752 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  39.89 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3041  DNA topoisomerase IV subunit A  39.26 
 
 		 756 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>