More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2247 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  57.01 
 
 		 744 aa  853    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  61.36 
 
 		 748 aa  951    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  62.17 
 
 		 758 aa  962    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  55.48 
 
 		 750 aa  824    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  63.38 
 
 		 770 aa  984    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  66.35 
 
 		 752 aa  1019    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  84.25 
 
 		 750 aa  1326    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  61.1 
 
 		 748 aa  948    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  61.38 
 
 		 758 aa  939    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  56.43 
 
 		 767 aa  855    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  95.19 
 
 		 749 aa  1462    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  62.93 
 
 		 748 aa  968    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  55.77 
 
 		 767 aa  842    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  64.19 
 
 		 748 aa  983    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  63.12 
 
 		 775 aa  981    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  57.3 
 
 		 743 aa  867    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  86.04 
 
 		 753 aa  1334    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  52.93 
 
 		 761 aa  759    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  56.97 
 
 		 775 aa  844    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  85.47 
 
 		 751 aa  1341    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  60.67 
 
 		 751 aa  921    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  62.43 
 
 		 748 aa  949    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  86.17 
 
 		 753 aa  1341    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 749 aa  1525    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  61.36 
 
 		 748 aa  952    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  56.3 
 
 		 782 aa  842    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  53.35 
 
 		 777 aa  803    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  63.51 
 
 		 770 aa  989    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  86.04 
 
 		 753 aa  1338    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  62.67 
 
 		 750 aa  973    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  62.52 
 
 		 748 aa  951    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  63.82 
 
 		 750 aa  988    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  58.31 
 
 		 758 aa  885    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  55.91 
 
 		 767 aa  844    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  56.28 
 
 		 743 aa  829    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  66.35 
 
 		 745 aa  1041    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  47.9 
 
 		 754 aa  686    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  58.59 
 
 		 777 aa  886    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  56.8 
 
 		 747 aa  858    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  60.93 
 
 		 751 aa  927    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  56.21 
 
 		 759 aa  838    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  59.81 
 
 		 745 aa  942    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  42.47 
 
 		 768 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  41.84 
 
 		 781 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  43.38 
 
 		 765 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  40.24 
 
 		 761 aa  538  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  40.32 
 
 		 756 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  40.32 
 
 		 756 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  40.48 
 
 		 750 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  40.92 
 
 		 752 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  40.99 
 
 		 793 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02891  DNA topoisomerase IV subunit A  40.78 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.78 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3456  DNA topoisomerase IV subunit A  40.65 
 
 		 752 aa  527  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  40.78 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  40.59 
 
 		 752 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02841  hypothetical protein  40.78 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440979  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3197  DNA topoisomerase IV subunit A  40.78 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  40.34 
 
 		 776 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  41.01 
 
 		 749 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  40.78 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  40.78 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  40.86 
 
 		 791 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3310  DNA topoisomerase IV subunit A  40.78 
 
 		 752 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.31337  normal  0.0249309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  40.42 
 
 		 780 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  40.46 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  39.63 
 
 		 762 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  40.46 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  40.42 
 
 		 780 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  40.37 
 
 		 758 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  40.46 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  40.46 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  41.5 
 
 		 744 aa  522  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  40.82 
 
 		 757 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  40.87 
 
 		 757 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  40.9 
 
 		 780 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004516  topoisomerase IV subunit A  39.67 
 
 		 761 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  41.41 
 
 		 773 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1982  DNA topoisomerase IV subunit A  42.84 
 
 		 750 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0348571  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  41.41 
 
 		 773 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  41.2 
 
 		 814 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  40.73 
 
 		 749 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  41.09 
 
 		 773 aa  515  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  41.27 
 
 		 773 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  41.27 
 
 		 773 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  41.27 
 
 		 773 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  41.01 
 
 		 754 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  38.75 
 
 		 756 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  41.14 
 
 		 773 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  41.81 
 
 		 772 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  38.84 
 
 		 769 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  40.91 
 
 		 747 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0662  DNA topoisomerase IV subunit A  40.68 
 
 		 757 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>