More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3350 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  59.59 
 
 		 748 aa  863    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  57.12 
 
 		 748 aa  834    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  55.24 
 
 		 751 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  57.37 
 
 		 770 aa  860    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  54.42 
 
 		 748 aa  798    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  55.01 
 
 		 777 aa  802    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  55.06 
 
 		 748 aa  809    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  55.72 
 
 		 750 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  56.69 
 
 		 749 aa  827    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  54.08 
 
 		 767 aa  796    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  57.12 
 
 		 758 aa  859    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  55.02 
 
 		 745 aa  839    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  55.24 
 
 		 751 aa  828    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  59.48 
 
 		 745 aa  862    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  60.19 
 
 		 743 aa  881    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  55.89 
 
 		 753 aa  811    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  53.07 
 
 		 761 aa  745    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  53.85 
 
 		 775 aa  796    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  56.1 
 
 		 751 aa  818    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  53.8 
 
 		 767 aa  801    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  58.29 
 
 		 748 aa  868    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  56.23 
 
 		 748 aa  821    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  56.1 
 
 		 753 aa  815    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  56.28 
 
 		 749 aa  829    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  55.56 
 
 		 753 aa  803    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  53.61 
 
 		 782 aa  791    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  51.27 
 
 		 777 aa  759    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  55.13 
 
 		 750 aa  786    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  57.65 
 
 		 750 aa  848    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  54.32 
 
 		 759 aa  804    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  57.85 
 
 		 770 aa  859    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  55.14 
 
 		 750 aa  820    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  54.21 
 
 		 767 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 743 aa  1495    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  55.61 
 
 		 758 aa  843    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  57.11 
 
 		 775 aa  855    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  56.69 
 
 		 758 aa  795    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  54.56 
 
 		 748 aa  799    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  49.04 
 
 		 754 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  56.76 
 
 		 747 aa  828    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  54.6 
 
 		 752 aa  819    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  64.97 
 
 		 744 aa  966    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  44.74 
 
 		 765 aa  569  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  44.72 
 
 		 814 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  43.03 
 
 		 781 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  44.77 
 
 		 773 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01152  DNA topoisomerase IV subunit A  45.62 
 
 		 747 aa  557  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.335625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  43.07 
 
 		 773 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  43.07 
 
 		 773 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  44.66 
 
 		 752 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  45.05 
 
 		 768 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  44.36 
 
 		 752 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  42.92 
 
 		 773 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  43.34 
 
 		 780 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  41.54 
 
 		 769 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  44.96 
 
 		 754 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  44.97 
 
 		 752 aa  554  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  43.24 
 
 		 756 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  44.88 
 
 		 773 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2395  DNA topoisomerase IV subunit A  44.88 
 
 		 773 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  44.96 
 
 		 754 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  44.88 
 
 		 773 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2277  DNA topoisomerase IV subunit A  44.74 
 
 		 773 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  45.32 
 
 		 757 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  44.9 
 
 		 772 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  43.1 
 
 		 756 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  44.84 
 
 		 750 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  44.21 
 
 		 752 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2519  DNA topoisomerase IV subunit A  43.07 
 
 		 776 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  42.92 
 
 		 780 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  44.21 
 
 		 752 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1146  DNA topoisomerase IV subunit A  44.9 
 
 		 772 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1138  DNA topoisomerase IV subunit A  44.9 
 
 		 772 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.988675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  43.82 
 
 		 758 aa  548  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2209  DNA topoisomerase IV subunit A  45.05 
 
 		 772 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  41.77 
 
 		 791 aa  548  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  45.05 
 
 		 772 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  42.39 
 
 		 780 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1301  DNA topoisomerase IV subunit A  44.9 
 
 		 772 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.42724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  43.5 
 
 		 747 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3338  DNA topoisomerase IV subunit A  44.25 
 
 		 774 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2085  DNA topoisomerase IV subunit A  45.05 
 
 		 772 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.688735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2528  DNA topoisomerase IV subunit A  45.05 
 
 		 772 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  44.23 
 
 		 744 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  44.21 
 
 		 749 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.71 
 
 		 758 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  44.02 
 
 		 747 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1206  DNA topoisomerase IV subunit A  43.93 
 
 		 774 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  41.49 
 
 		 793 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  43.66 
 
 		 752 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0581  DNA topoisomerase IV subunit A  44.41 
 
 		 757 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0554  DNA topoisomerase IV subunit A  43.47 
 
 		 751 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  43.66 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  43.66 
 
 		 752 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  43.79 
 
 		 752 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  43.66 
 
 		 752 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  43.66 
 
 		 752 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  42.69 
 
 		 761 aa  537  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2194  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 		 762 aa  538  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  43.66 
 
 		 752 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.508953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>