More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1611 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  48.53 
 
 		 767 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1208  DNA topoisomerase IV subunit A  51.23 
 
 		 744 aa  735    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0547844  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2027  DNA topoisomerase IV subunit A  50.89 
 
 		 748 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  48.19 
 
 		 777 aa  702    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0754  DNA topoisomerase IV subunit A  49.34 
 
 		 770 aa  716    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.92701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0107  DNA topoisomerase IV subunit A  49.25 
 
 		 750 aa  694    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0749  DNA topoisomerase IV subunit A  49.21 
 
 		 775 aa  713    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  50.27 
 
 		 748 aa  719    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  51.79 
 
 		 745 aa  741    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  48.99 
 
 		 767 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  47.95 
 
 		 749 aa  683    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  50 
 
 		 748 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  49.13 
 
 		 767 aa  702    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1744  DNA topoisomerase IV subunit A  46.74 
 
 		 759 aa  662    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1848  DNA topoisomerase IV subunit A  53.92 
 
 		 743 aa  763    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.44724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0807  DNA topoisomerase IV subunit A  49.4 
 
 		 758 aa  726    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2620  DNA topoisomerase IV subunit A  48.09 
 
 		 753 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2793  DNA topoisomerase IV subunit A  46.02 
 
 		 761 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  46.72 
 
 		 775 aa  675    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0867  DNA topoisomerase IV subunit A  50.27 
 
 		 745 aa  734    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.885573  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  48.49 
 
 		 751 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  47.09 
 
 		 753 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  50.21 
 
 		 748 aa  726    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2655  DNA topoisomerase IV subunit A  48.04 
 
 		 753 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  50.34 
 
 		 748 aa  722    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  47.9 
 
 		 749 aa  686    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  50.48 
 
 		 748 aa  723    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1108  DNA topoisomerase IV subunit A  49.66 
 
 		 751 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  47.35 
 
 		 782 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2108  DNA topoisomerase IV subunit A  47.05 
 
 		 777 aa  664    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.258471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  48.44 
 
 		 752 aa  695    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  48.48 
 
 		 750 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  50.82 
 
 		 750 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  50.07 
 
 		 750 aa  701    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2539  DNA topoisomerase IV subunit A  48.95 
 
 		 770 aa  712    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1595  DNA topoisomerase IV subunit A  48.86 
 
 		 758 aa  714    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1255  DNA topoisomerase IV subunit A  49.12 
 
 		 751 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  50.55 
 
 		 748 aa  720    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  48.31 
 
 		 758 aa  693    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3350  DNA topoisomerase IV subunit A  49.04 
 
 		 743 aa  714    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.80382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 754 aa  1544    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  51.87 
 
 		 747 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  42.99 
 
 		 768 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  42.96 
 
 		 752 aa  586  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  43.35 
 
 		 749 aa  585  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  42.24 
 
 		 753 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  42.01 
 
 		 754 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  41.87 
 
 		 754 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  41.89 
 
 		 781 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2119  DNA topoisomerase IV subunit A  41.7 
 
 		 749 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  41.19 
 
 		 749 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  41.49 
 
 		 761 aa  572  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  41.7 
 
 		 753 aa  570  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  40.73 
 
 		 765 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  41.7 
 
 		 751 aa  568  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  40.94 
 
 		 752 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  41.21 
 
 		 752 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  41.21 
 
 		 752 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4188  DNA topoisomerase IV subunit A  40.24 
 
 		 758 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00492  DNA topoisomerase IV subunit A  41.02 
 
 		 761 aa  561  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  40.94 
 
 		 752 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.93 
 
 		 758 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1982  DNA topoisomerase IV subunit A  42.45 
 
 		 750 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0348571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  42.25 
 
 		 744 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0902  DNA topoisomerase IV subunit A  40.97 
 
 		 780 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0287321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  39.84 
 
 		 769 aa  555  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  43.34 
 
 		 756 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0384  DNA topoisomerase IV subunit A  40.58 
 
 		 742 aa  555  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.4801  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0831  DNA topoisomerase IV subunit A  41.11 
 
 		 780 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.718919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3325  DNA topoisomerase IV subunit A  40.65 
 
 		 767 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.846721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  43.02 
 
 		 756 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0551  DNA topoisomerase IV subunit A  40.38 
 
 		 755 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.243647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  41.13 
 
 		 793 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3897  DNA topoisomerase IV subunit A  40.11 
 
 		 758 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4960  DNA topoisomerase IV, A subunit  39.97 
 
 		 751 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  40.98 
 
 		 757 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  42.9 
 
 		 773 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  41.7 
 
 		 747 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  43.13 
 
 		 773 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0941  DNA topoisomerase IV subunit A  44.24 
 
 		 772 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.612887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  43.13 
 
 		 752 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  40.24 
 
 		 762 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  41.02 
 
 		 758 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0554  DNA topoisomerase IV subunit A  39.97 
 
 		 751 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  40.68 
 
 		 756 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  42.39 
 
 		 780 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0775  DNA topoisomerase IV subunit A  40.43 
 
 		 758 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0849191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0503  DNA topoisomerase IV subunit A  39.84 
 
 		 754 aa  552  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004516  topoisomerase IV subunit A  40.65 
 
 		 761 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  43.03 
 
 		 773 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3218  DNA topoisomerase IV subunit A  40.24 
 
 		 770 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000131393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  40.62 
 
 		 750 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1747  DNA topoisomerase IV subunit A  42.9 
 
 		 773 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  41.38 
 
 		 757 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  42.9 
 
 		 773 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3041  DNA topoisomerase IV subunit A  40.29 
 
 		 756 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0732  DNA topoisomerase IV subunit A  40.51 
 
 		 758 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207588  decreased coverage  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0276  DNA topoisomerase IV subunit A  41.49 
 
 		 757 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01152  DNA topoisomerase IV subunit A  41.11 
 
 		 747 aa  548  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.335625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0695  DNA topoisomerase IV subunit A  43.81 
 
 		 772 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>