More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2557 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  67.17 
 
 
807 aa  1091    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  56.02 
 
 
800 aa  923    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  44.44 
 
 
820 aa  665    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  67.54 
 
 
807 aa  1117    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  67.54 
 
 
807 aa  1117    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  54.23 
 
 
819 aa  834    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  67.42 
 
 
807 aa  1117    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  67.42 
 
 
807 aa  1117    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  67.42 
 
 
807 aa  1117    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  43.03 
 
 
818 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  44.35 
 
 
827 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  67.54 
 
 
807 aa  1092    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  67.42 
 
 
807 aa  1117    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  44.02 
 
 
825 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
814 aa  1659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  68.87 
 
 
807 aa  1125    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  45.37 
 
 
818 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  67.29 
 
 
807 aa  1116    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  67.29 
 
 
807 aa  1117    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  51.23 
 
 
821 aa  803    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  56.52 
 
 
800 aa  911    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  56.52 
 
 
800 aa  911    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  51.85 
 
 
824 aa  846    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  43.66 
 
 
816 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  50.76 
 
 
811 aa  731    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  52.07 
 
 
826 aa  827    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  49.88 
 
 
812 aa  800    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  53.53 
 
 
806 aa  842    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  79.43 
 
 
814 aa  1335    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  44.7 
 
 
823 aa  633  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  44.7 
 
 
823 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  44.7 
 
 
823 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  44.7 
 
 
823 aa  633  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  44.7 
 
 
823 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  44.57 
 
 
823 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  43.3 
 
 
811 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  44.57 
 
 
821 aa  631  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  44.44 
 
 
823 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.8 
 
 
807 aa  631  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  44.42 
 
 
823 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  43.22 
 
 
848 aa  631  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  42.89 
 
 
908 aa  628  1e-178  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  41.94 
 
 
819 aa  626  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  43.16 
 
 
823 aa  628  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  41.69 
 
 
878 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  43.84 
 
 
839 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  43.84 
 
 
839 aa  628  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  44.32 
 
 
823 aa  627  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  41.24 
 
 
807 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.88 
 
 
899 aa  624  1e-177  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  44.49 
 
 
802 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  44.53 
 
 
824 aa  620  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  42.06 
 
 
809 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  40.7 
 
 
809 aa  621  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  42.95 
 
 
836 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  42.54 
 
 
893 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3019  DNA gyrase subunit A  41.45 
 
 
877 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.542004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  41.45 
 
 
879 aa  617  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  44.79 
 
 
823 aa  616  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  42.26 
 
 
824 aa  618  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  44.79 
 
 
823 aa  618  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  42.23 
 
 
852 aa  614  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  41.58 
 
 
808 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  42.62 
 
 
836 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  41.82 
 
 
814 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  42.66 
 
 
834 aa  611  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1105  DNA gyrase subunit A  41.21 
 
 
879 aa  611  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0580579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  40.97 
 
 
882 aa  612  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 
885 aa  609  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  40.69 
 
 
829 aa  611  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  42.31 
 
 
796 aa  611  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  41.92 
 
 
932 aa  608  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  41.88 
 
 
832 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  40.88 
 
 
894 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  43.63 
 
 
901 aa  606  9.999999999999999e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  42.75 
 
 
836 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  43.9 
 
 
806 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  41.62 
 
 
878 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  41.45 
 
 
840 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  41.1 
 
 
811 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  42.86 
 
 
838 aa  602  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  41.88 
 
 
899 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  41.82 
 
 
865 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  43.77 
 
 
979 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  43.77 
 
 
979 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  40.52 
 
 
812 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  40.33 
 
 
860 aa  602  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  41.9 
 
 
805 aa  600  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  40.64 
 
 
840 aa  598  1e-170  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  39.75 
 
 
816 aa  599  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  40.96 
 
 
949 aa  599  1e-170  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  42.1 
 
 
827 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  39.48 
 
 
848 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  41.41 
 
 
808 aa  598  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  39.42 
 
 
907 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0387  DNA gyrase, A subunit  39.5 
 
 
847 aa  596  1e-169  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  40.21 
 
 
856 aa  598  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  40.5 
 
 
813 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02116  hypothetical protein  40.62 
 
 
875 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  39.31 
 
 
863 aa  594  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>