More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1417 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  57.7 
 
 
807 aa  921    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  83.44 
 
 
800 aa  1359    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  57.95 
 
 
807 aa  922    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  51.86 
 
 
819 aa  796    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  57.95 
 
 
807 aa  922    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  57.95 
 
 
807 aa  922    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  45.88 
 
 
908 aa  648    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  57.95 
 
 
807 aa  922    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  57.7 
 
 
807 aa  902    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  57.95 
 
 
807 aa  922    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  58.05 
 
 
814 aa  956    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  58.95 
 
 
807 aa  928    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  56.52 
 
 
814 aa  952    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  57.95 
 
 
807 aa  922    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  57.95 
 
 
807 aa  922    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
800 aa  1626    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  57.82 
 
 
807 aa  898    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  50.81 
 
 
821 aa  791    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  54.05 
 
 
824 aa  805    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  48.96 
 
 
811 aa  748    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  50.69 
 
 
826 aa  806    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  47.88 
 
 
812 aa  764    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  52.96 
 
 
806 aa  813    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
800 aa  1626    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  43.5 
 
 
899 aa  629  1e-179  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  44.11 
 
 
821 aa  625  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  44.41 
 
 
827 aa  623  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  43.25 
 
 
807 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  43.32 
 
 
820 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  42.86 
 
 
818 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  46.92 
 
 
979 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  41.44 
 
 
809 aa  609  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  43.4 
 
 
825 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  44.35 
 
 
839 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 
839 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  46.92 
 
 
979 aa  612  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  42.44 
 
 
823 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 
823 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 
823 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.93 
 
 
852 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  42.18 
 
 
823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 
823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 
823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 
823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 
823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  39.92 
 
 
949 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  42.18 
 
 
823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  42.44 
 
 
823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  43.44 
 
 
816 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  39.9 
 
 
807 aa  592  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  43.17 
 
 
818 aa  592  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  39.75 
 
 
829 aa  592  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.74 
 
 
852 aa  587  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  39.9 
 
 
811 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  42 
 
 
932 aa  588  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  41.82 
 
 
815 aa  582  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  40.61 
 
 
855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  42.42 
 
 
848 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  39.2 
 
 
812 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  42.32 
 
 
893 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  40.33 
 
 
811 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  41.53 
 
 
814 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  42.72 
 
 
819 aa  580  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  41.49 
 
 
802 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  40.44 
 
 
838 aa  576  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  41.89 
 
 
814 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  41.19 
 
 
901 aa  578  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  41.05 
 
 
816 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.73 
 
 
828 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40.03 
 
 
809 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  42.52 
 
 
834 aa  574  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  41.03 
 
 
819 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  40.4 
 
 
809 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 
809 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  43.13 
 
 
840 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  38.46 
 
 
813 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  42.22 
 
 
809 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  40.58 
 
 
875 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  38.87 
 
 
848 aa  571  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  38.06 
 
 
855 aa  572  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  40 
 
 
856 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  40.18 
 
 
899 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  43.07 
 
 
809 aa  569  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  41.37 
 
 
889 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  38.5 
 
 
812 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  41.37 
 
 
889 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  41.08 
 
 
836 aa  570  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  39.65 
 
 
817 aa  570  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  38.8 
 
 
883 aa  568  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  38.65 
 
 
796 aa  566  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  37.9 
 
 
806 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  37.96 
 
 
865 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  40.95 
 
 
865 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  40.95 
 
 
870 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  40.43 
 
 
808 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  40.43 
 
 
836 aa  562  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  40.72 
 
 
879 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  40.53 
 
 
833 aa  556  1e-157  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  36.17 
 
 
856 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  38.5 
 
 
816 aa  558  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>