More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1000 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  50.69 
 
 
800 aa  779    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  51.05 
 
 
800 aa  822    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  54.45 
 
 
814 aa  870    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  52.63 
 
 
807 aa  809    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  53.16 
 
 
819 aa  868    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  52.63 
 
 
807 aa  811    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  52.63 
 
 
807 aa  811    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  44.66 
 
 
908 aa  639    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  52.63 
 
 
807 aa  811    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  52.63 
 
 
807 aa  811    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  53.02 
 
 
807 aa  817    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  51.5 
 
 
807 aa  793    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  52.63 
 
 
807 aa  811    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  57.28 
 
 
821 aa  942    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  44.32 
 
 
899 aa  660    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  51.88 
 
 
807 aa  799    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  52.07 
 
 
814 aa  827    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  52.63 
 
 
807 aa  809    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  52.26 
 
 
807 aa  808    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  50.69 
 
 
800 aa  779    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  52.73 
 
 
824 aa  865    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  54.86 
 
 
811 aa  824    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
826 aa  1683    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  53.91 
 
 
812 aa  881    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  53.94 
 
 
806 aa  865    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  41.41 
 
 
949 aa  610  1e-173  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  37.79 
 
 
809 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.03 
 
 
852 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  40.88 
 
 
855 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  40.86 
 
 
893 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.18 
 
 
809 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  41.29 
 
 
820 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  39.68 
 
 
819 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  40.95 
 
 
807 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  38.92 
 
 
827 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.9 
 
 
807 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.12 
 
 
899 aa  559  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  42.92 
 
 
818 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  39.82 
 
 
889 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  39.82 
 
 
889 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  39.65 
 
 
932 aa  547  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  37.82 
 
 
832 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  36.76 
 
 
848 aa  547  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  42.37 
 
 
829 aa  548  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40.21 
 
 
809 aa  543  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  37.31 
 
 
852 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  38.49 
 
 
802 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  42.63 
 
 
979 aa  545  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  42.63 
 
 
979 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  41.35 
 
 
848 aa  544  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  37.73 
 
 
824 aa  545  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  38.95 
 
 
808 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 
865 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  39.13 
 
 
838 aa  538  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  37.08 
 
 
855 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  39.81 
 
 
809 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 
821 aa  538  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.28 
 
 
814 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  39.81 
 
 
809 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  37.44 
 
 
836 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  37.55 
 
 
812 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  37.56 
 
 
836 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  39.37 
 
 
833 aa  533  1e-150  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  39.51 
 
 
816 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 
823 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  40.99 
 
 
806 aa  535  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  37.93 
 
 
840 aa  535  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  38.63 
 
 
823 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  41.62 
 
 
866 aa  534  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  36.73 
 
 
859 aa  530  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  41.93 
 
 
815 aa  530  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.5 
 
 
823 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.5 
 
 
823 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.5 
 
 
823 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.5 
 
 
823 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  38.5 
 
 
823 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  37.48 
 
 
818 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.37 
 
 
823 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.37 
 
 
823 aa  529  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.37 
 
 
823 aa  529  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  35.82 
 
 
811 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  36.71 
 
 
834 aa  526  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  37.97 
 
 
838 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  37.91 
 
 
839 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  37.78 
 
 
839 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  38.61 
 
 
828 aa  529  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  37.75 
 
 
836 aa  528  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  37.86 
 
 
825 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  42.33 
 
 
834 aa  523  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  37.22 
 
 
808 aa  522  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  37.44 
 
 
814 aa  525  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  40.33 
 
 
870 aa  523  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  38.06 
 
 
812 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  38.33 
 
 
830 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 
806 aa  522  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  37.11 
 
 
859 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  39.31 
 
 
870 aa  520  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  36.28 
 
 
830 aa  520  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  37.96 
 
 
901 aa  521  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  37.56 
 
 
796 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>