More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1070 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  53.03 
 
 
814 aa  831    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  50.25 
 
 
800 aa  786    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  53.61 
 
 
807 aa  811    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  54.05 
 
 
800 aa  776    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  70.22 
 
 
819 aa  1199    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  53.48 
 
 
807 aa  811    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  53.48 
 
 
807 aa  811    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  46.49 
 
 
908 aa  672    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  53.48 
 
 
807 aa  811    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  54.05 
 
 
800 aa  776    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  57.3 
 
 
821 aa  874    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  53.61 
 
 
807 aa  811    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  53.48 
 
 
807 aa  811    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  53.48 
 
 
807 aa  797    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  54.14 
 
 
807 aa  804    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  44.65 
 
 
899 aa  651    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  53.61 
 
 
807 aa  811    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  53.74 
 
 
807 aa  813    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  53.34 
 
 
807 aa  800    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  51.85 
 
 
814 aa  846    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
824 aa  1690    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  50.62 
 
 
811 aa  778    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  52.73 
 
 
826 aa  865    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  52.29 
 
 
812 aa  805    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  70.84 
 
 
806 aa  1182    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  43.3 
 
 
852 aa  588  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  43.16 
 
 
855 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  42.01 
 
 
949 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.51 
 
 
809 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  39.25 
 
 
848 aa  553  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  40.99 
 
 
827 aa  555  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 
901 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  42.08 
 
 
809 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  40.44 
 
 
802 aa  547  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  41.3 
 
 
807 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  41.41 
 
 
979 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  41.41 
 
 
979 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  39.79 
 
 
829 aa  548  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  38.17 
 
 
820 aa  542  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  40.68 
 
 
821 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  38.66 
 
 
852 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  40.77 
 
 
848 aa  542  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  40.54 
 
 
818 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  37.11 
 
 
832 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  38.49 
 
 
819 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  38.26 
 
 
836 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  39.11 
 
 
823 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.8 
 
 
823 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.12 
 
 
899 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  38.39 
 
 
836 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  38.99 
 
 
839 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  40.86 
 
 
836 aa  536  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  37.66 
 
 
828 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.93 
 
 
823 aa  535  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.93 
 
 
823 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.93 
 
 
823 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.93 
 
 
823 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  39.32 
 
 
823 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  38.93 
 
 
823 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.93 
 
 
823 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.53 
 
 
823 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  38.87 
 
 
839 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  40.08 
 
 
817 aa  534  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  38.4 
 
 
833 aa  530  1e-149  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  38.48 
 
 
932 aa  530  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  39.71 
 
 
811 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  37.66 
 
 
865 aa  531  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  36.46 
 
 
838 aa  528  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  38.88 
 
 
819 aa  523  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 
809 aa  524  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.27 
 
 
814 aa  525  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  40 
 
 
796 aa  525  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  38.38 
 
 
816 aa  525  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  39.87 
 
 
834 aa  521  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  36.15 
 
 
835 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.29 
 
 
818 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  38.84 
 
 
806 aa  522  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  40.28 
 
 
913 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  38.47 
 
 
922 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  38.99 
 
 
875 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  38.65 
 
 
814 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  38.47 
 
 
934 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4493  DNA gyrase, A subunit  38.02 
 
 
891 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0318161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  35.23 
 
 
857 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  37.76 
 
 
893 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  38.93 
 
 
879 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  38.91 
 
 
824 aa  515  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  37.08 
 
 
819 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  37.99 
 
 
830 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  38.11 
 
 
804 aa  513  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  37.05 
 
 
807 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  38.67 
 
 
808 aa  515  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  38.38 
 
 
812 aa  515  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 
825 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  38.11 
 
 
804 aa  513  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  35.81 
 
 
856 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  38.13 
 
 
815 aa  512  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  38.18 
 
 
830 aa  512  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  39.41 
 
 
913 aa  512  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  37.79 
 
 
923 aa  512  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>