More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0456 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  60.81 
 
 
908 aa  1089    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  100 
 
 
899 aa  1791    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  44.65 
 
 
824 aa  651    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  44.32 
 
 
826 aa  660    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  43.8 
 
 
819 aa  635  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  41.88 
 
 
814 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  43.39 
 
 
806 aa  623  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  42.71 
 
 
800 aa  620  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  44.88 
 
 
814 aa  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  43.72 
 
 
821 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  43.27 
 
 
807 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  44.53 
 
 
807 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  44.53 
 
 
807 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  44.67 
 
 
807 aa  612  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  44.67 
 
 
807 aa  612  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  44.67 
 
 
807 aa  612  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  44.67 
 
 
807 aa  611  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  44.53 
 
 
807 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  44.67 
 
 
807 aa  612  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  43.5 
 
 
800 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  43.5 
 
 
800 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  44.67 
 
 
807 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  41.7 
 
 
812 aa  598  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.87 
 
 
852 aa  594  1e-168  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  43.99 
 
 
807 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  42.11 
 
 
855 aa  591  1e-167  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  41.54 
 
 
811 aa  550  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  41.35 
 
 
949 aa  548  1e-154  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  39.1 
 
 
806 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  39.31 
 
 
827 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  37.74 
 
 
852 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  38.69 
 
 
809 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  38.83 
 
 
836 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  38.55 
 
 
836 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  35.24 
 
 
820 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  37.86 
 
 
932 aa  510  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  39.48 
 
 
807 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  35.82 
 
 
833 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  37.43 
 
 
816 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  37.84 
 
 
818 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  36.71 
 
 
808 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  38.52 
 
 
816 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  39.04 
 
 
819 aa  508  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  37.58 
 
 
893 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  40.83 
 
 
814 aa  506  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  37.85 
 
 
832 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  36.71 
 
 
807 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  35.46 
 
 
870 aa  500  1e-140  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  38.22 
 
 
898 aa  502  1e-140  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  34.74 
 
 
865 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  36.84 
 
 
865 aa  501  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  37.35 
 
 
839 aa  502  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  37.64 
 
 
828 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  38.21 
 
 
899 aa  498  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  34.63 
 
 
802 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  38.53 
 
 
808 aa  496  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  37.22 
 
 
839 aa  499  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  38.86 
 
 
796 aa  497  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  36.85 
 
 
818 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  38.62 
 
 
811 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  37.89 
 
 
843 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  37.13 
 
 
848 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  36.51 
 
 
809 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  39.56 
 
 
817 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  38.55 
 
 
809 aa  491  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  39.36 
 
 
840 aa  492  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  39.77 
 
 
821 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  37.83 
 
 
834 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  36.99 
 
 
815 aa  486  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  38.23 
 
 
819 aa  487  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  35.13 
 
 
812 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  38.32 
 
 
788 aa  486  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  37.09 
 
 
816 aa  487  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  35.2 
 
 
830 aa  488  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  35.44 
 
 
883 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  38.78 
 
 
866 aa  487  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  37.13 
 
 
848 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  38.28 
 
 
809 aa  483  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  35.75 
 
 
857 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  37.48 
 
 
859 aa  484  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  39.07 
 
 
823 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  37.52 
 
 
809 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  38.13 
 
 
835 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.21 
 
 
823 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  36.21 
 
 
806 aa  484  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  38.9 
 
 
840 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  35.5 
 
 
812 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  37.84 
 
 
879 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0323  DNA gyrase, A subunit  39.73 
 
 
846 aa  484  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  38.23 
 
 
809 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  36.02 
 
 
830 aa  486  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  36.65 
 
 
812 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  38.82 
 
 
836 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  36.13 
 
 
838 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  35.59 
 
 
848 aa  485  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.93 
 
 
823 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  36.45 
 
 
871 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  38.76 
 
 
863 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  35.54 
 
 
839 aa  479  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0958  DNA gyrase, A subunit  39.01 
 
 
869 aa  482  1e-134  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.687987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>