More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0783 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  52.01 
 
 
800 aa  799    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  51.66 
 
 
807 aa  805    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  56.19 
 
 
819 aa  904    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  51.83 
 
 
807 aa  788    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  51.66 
 
 
807 aa  805    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  51.66 
 
 
807 aa  806    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  51.66 
 
 
807 aa  806    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  51.66 
 
 
807 aa  806    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  53.27 
 
 
814 aa  846    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  51.47 
 
 
807 aa  786    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  51.66 
 
 
807 aa  806    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  50.94 
 
 
800 aa  779    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  51.66 
 
 
807 aa  806    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  50.94 
 
 
800 aa  779    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  51.96 
 
 
807 aa  807    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
821 aa  1681    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  51.23 
 
 
814 aa  826    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  57.3 
 
 
824 aa  891    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  53.51 
 
 
811 aa  876    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  57.28 
 
 
826 aa  958    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  58.43 
 
 
812 aa  949    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  60.11 
 
 
806 aa  904    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  52.61 
 
 
807 aa  805    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  43.72 
 
 
899 aa  634  1e-180  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  42.11 
 
 
908 aa  627  1e-178  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  43.22 
 
 
818 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  44.25 
 
 
814 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.59 
 
 
807 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  40.42 
 
 
949 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  41.63 
 
 
820 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  42.59 
 
 
839 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  42.59 
 
 
839 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  41.54 
 
 
827 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  40.38 
 
 
807 aa  571  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  42.99 
 
 
866 aa  572  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  42.42 
 
 
848 aa  571  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  41.79 
 
 
809 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  39.97 
 
 
901 aa  561  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  41.45 
 
 
825 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  40.94 
 
 
852 aa  560  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.73 
 
 
816 aa  562  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  41.79 
 
 
829 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  40.84 
 
 
821 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.57 
 
 
823 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  40.61 
 
 
796 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.57 
 
 
823 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 
823 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 
823 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 
823 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 
823 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  42.7 
 
 
834 aa  555  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 
823 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  41.35 
 
 
818 aa  555  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 
823 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 
823 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  38.5 
 
 
848 aa  555  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  39.27 
 
 
865 aa  555  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  41.61 
 
 
836 aa  553  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  41.43 
 
 
899 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 
823 aa  552  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.36 
 
 
809 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  39.56 
 
 
852 aa  552  1e-155  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  41.28 
 
 
893 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  39.79 
 
 
859 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  39.43 
 
 
855 aa  548  1e-154  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  39.97 
 
 
824 aa  545  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 
811 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  40.24 
 
 
809 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  40.79 
 
 
889 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  39.49 
 
 
809 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  40.19 
 
 
913 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  39.3 
 
 
826 aa  541  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  40.79 
 
 
889 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  37.94 
 
 
828 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  40.24 
 
 
812 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  39.46 
 
 
809 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  39.76 
 
 
832 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  41.05 
 
 
796 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  38.38 
 
 
830 aa  539  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  40.16 
 
 
836 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  38.54 
 
 
860 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  39.46 
 
 
838 aa  538  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  39.22 
 
 
809 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  39.56 
 
 
816 aa  536  1e-151  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  40.41 
 
 
819 aa  536  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  39.89 
 
 
836 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  39.04 
 
 
827 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  38.58 
 
 
912 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  39.68 
 
 
840 aa  536  1e-151  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  40.59 
 
 
817 aa  538  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  39.81 
 
 
870 aa  535  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  38.75 
 
 
859 aa  535  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  40.65 
 
 
819 aa  533  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  39.75 
 
 
827 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  39.02 
 
 
913 aa  534  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 
802 aa  535  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
979 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  41.1 
 
 
979 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  40.13 
 
 
840 aa  535  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  39.01 
 
 
814 aa  533  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>