Gene UUR10_0524 details

Gene Information

• Locus tag: UUR10_0524
• Symbol: parC
• ID: 6984208
• Type: CDS
• Is gene spliced: No
• Is pseudo gene: No
• Organism name: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699
• Kingdom: Bacteria
• Replicon accession: NC_011374
• Strand: +
• Start bp: 601256
• End bp: 603814
• Gene Length: 2559 bp
• Protein Length: 852 aa
• Translation table: 4
• GC content: 26%
• IMG OID: 643400090
• Product: DNA topoisomerase IV, A subunit
• Protein accession: YP_002284910
• Protein GI: 209554590
• COG category: [L] Replication, recombination and repair
• COG ID: [COG0188] Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
• TIGRFAM ID: [TIGR01061] DNA topoisomerase IV, A subunit, Gram-positive

Plasmid Coverage information

• Num covering plasmid clones: 6
• Plasmid unclonability p-value: 0.72037
• Plasmid hitchhiking: No
• Plasmid clonability: normal

Fosmid Coverage information

• Num covering fosmid clones: n/a
• Fosmid unclonability p-value: n/a
• Fosmid Hitchhiker: n/a
• Fosmid clonability: n/a

Sequence

Gene sequence

ATGAGTGTAA ATCAACAAAA AATTATTAAT ACACCATTAG ACAACATTGT TGGTGAAAGT 
TATGCTAAAT ATGCAAAATA TATTATTCAA GATCGTGCTT TACCAGATAT TCGTGATGGT 
TTAAAACCCG TTCAACGACG TATTTTGTAT GCCATGAGCG AATTAGGAAT TTTTCATGAC 
AAACCTTACA AAAAATCAGC ACGTACAGTT GGGGAAGTAA TTGGTAAATA CCACCCTCAT 
GGTGATTCAT CAATTTATGA AGCTATGGTA AGAATGAGTC AAGATTGAAA AAATAATTTA 
TGCTTATTAG ATATGCATGG TAATAAAGGT TCGATTGATG GTGATAACGC TGCTGCGATG 
CGTTATACAG AAACACGTTT ATCAAAAATT GCTAGTGTAA TGCTAACTAA TTTAAAAAAA 
GATGTAGTTA AATTTAGTCC AAACTTTGAT GATAGTGAAA AAGAACCATC AATTTTACCA 
TCACTTTTTC CTAACTTATT AATTAATGGA GCAACAGGAA TTGCTTCAGG ATATGCAACA 
AGTATTCCAC CTCATAATCC TAATGAAGTT TTTGATGCTT TAATTTATCG AATTGATCAT 
CCAGATTGTA GTATTGAAAA ATTAATTAAA ATTTGTCCAG CGCCAGATTT CCCAACAGGG 
GGAGAAATTC ATGATTTAAA TGGATGTGCA AATGCTCACA AAACTGGTGA AGGTAAATTT 
GTAATCCGAG CTTCAATTGA ATTTAAAACA AGTGAAGCAA AAATTAATCA AATCATTATT 
AATTCCATTC CTTATGAAAC AAATAAAGCT TTAATTATTA AAGAAATTGA AGATATTATT 
TACAATAAAG AAGTTGCTGG TTTAATCGAA GTTCGTGATG AATCAGATGC TAAGGGTGTT 
AGCATTATCA TTGATACTAA AAAAGATGTT AATTTAGAAA ATGTTAAAAA TTATTTATAC 
AAAAAAACTA GTTTGGAAAT TAGTTATAAT ACAAAATTTA TTGCAATTGT TCATCGAACA 
CCAACACTTG TAAGTTTATC AACGTATCTA GATGCGCAAA TCAACCATAG TCTTGATGTT 
ATTAATAAAG TTGATTTATA TGATTTAAAT AAAGTTTTAT TACGTATTGA AATTGTTGAA 
GGTTTAATTA AATGTGTTGA TTTAATCGAT GAAATTATTA AAATTATTCG GGCTAGTGAT 
TCACGCCAAG ACGCAAAAAA TGCTTTAATT CAAACATTTG CTTTTACTAA TAATCAAGCT 
GAAGCAATTA TTATGATGCG TTTGCATAAT TTAACACGCA CAGATATATT TGATTTAAGA 
AATGAATGAG AAAGTCTTCA ACAACAAGCT AAAACACTAA AAGAGCGAAT TAAATCACTT 
CAAGTTCGCA AAAATTATTT AAAACAAAAA ATGATTGAAT TCAAAAAAGA ATTTGGTTAT 
CAACGTAAAA CAAAATTATT TGATGAGTTT ATAAAAGCTG AAGTTAATGA AGATCAAATG 
ATTGAAAAAC AAAGTTTAAA TTTAGTTATT AGTCGTGATG GATATATTAA AACTGTTTCT 
AAAAAATCAT TTGAATCTTC AAAATATGAT GAATTAGGGC TAAAAACTAA TGATCTTCTT 
TTTTATCACA ATGTAATTAA TTCGCATGAT CGAATTTTAA TTATTACATC AAAAGCAAAA 
TTAATTAATT TAATTGCACA TAAAATTAGT TGTATGCGTT GAAAAGATGT TGGTGAACAT 
TTAAATAATT ATGCTAAATT TGATGCTAAT GAAAAAGTTG TAGCAGTTTA TGTATGCAAT 
GAACAATTTA AAGTTGATGA ACACCAATTA GTTTTAGGTT CAAAACTAAA TTTAATTAAA 
AGAATTGAAT TAAATGAGTT AGATTTAAAT AAAAATAGCA AACAAATTAG TATTATGAAA 
CTAAATGAAA ATGATGGTTT AATTAGTGCT AATTTAATTA AAAAAGATCA TAATCAATTT 
GTTGTTGCAA TTTCTAAACT AGGGTTAGTG TTAATGTTTT TAGTTCATGA AATTAATTGT 
TTAAATCGTT TAGCAAAAGG GATTAAAATC ATGAAATTAA AACCAAATGA TGAAATTAGT 
TCAATTCTAA TCGTTCCTAA TAATGGTTAT AGTATTCAAC TTTTTTTAGA TCAAGGTAAT 
AAGTGTTTTA GTATTAGTGA GCTAAAATTA TCAAAACGTG CAATGACACC ATCACCACTT 
TATTTACCAA CAAAAAAAGC ACAAAGCGTT TTAGCAGCAT TTTTAGTTGG TAATGAAAAT 
GTTTTCTATT TATTAGATGA ACAACAAAAA ATAAATCCAT ACTATTTACC AAATCTAAAA 
CCAATAAAAT TAGATTCTAA AATTAATAAA TACGAAAATG ATCTTATTAT AACTGATGTT 
GTTAAAGATA GTTTTTTAAG TGATAGTGTT ATAAGTGATT TTAAAAAAAT TAGTATGTAT 
GCAAATGAAT TTGATAGTGA ATTATTAAAA ACTAATGAAA ATCAAGAGCA AGATGATTTG 
CAATTAGAAT TAATTAATGA GAAAGAAGAA AATGATTAA 

 

Protein sequence

MSVNQQKIIN TPLDNIVGES YAKYAKYIIQ DRALPDIRDG LKPVQRRILY AMSELGIFHD 
KPYKKSARTV GEVIGKYHPH GDSSIYEAMV RMSQDWKNNL CLLDMHGNKG SIDGDNAAAM 
RYTETRLSKI ASVMLTNLKK DVVKFSPNFD DSEKEPSILP SLFPNLLING ATGIASGYAT 
SIPPHNPNEV FDALIYRIDH PDCSIEKLIK ICPAPDFPTG GEIHDLNGCA NAHKTGEGKF 
VIRASIEFKT SEAKINQIII NSIPYETNKA LIIKEIEDII YNKEVAGLIE VRDESDAKGV 
SIIIDTKKDV NLENVKNYLY KKTSLEISYN TKFIAIVHRT PTLVSLSTYL DAQINHSLDV 
INKVDLYDLN KVLLRIEIVE GLIKCVDLID EIIKIIRASD SRQDAKNALI QTFAFTNNQA 
EAIIMMRLHN LTRTDIFDLR NEWESLQQQA KTLKERIKSL QVRKNYLKQK MIEFKKEFGY 
QRKTKLFDEF IKAEVNEDQM IEKQSLNLVI SRDGYIKTVS KKSFESSKYD ELGLKTNDLL 
FYHNVINSHD RILIITSKAK LINLIAHKIS CMRWKDVGEH LNNYAKFDAN EKVVAVYVCN 
EQFKVDEHQL VLGSKLNLIK RIELNELDLN KNSKQISIMK LNENDGLISA NLIKKDHNQF 
VVAISKLGLV LMFLVHEINC LNRLAKGIKI MKLKPNDEIS SILIVPNNGY SIQLFLDQGN 
KCFSISELKL SKRAMTPSPL YLPTKKAQSV LAAFLVGNEN VFYLLDEQQK INPYYLPNLK 
PIKLDSKINK YENDLIITDV VKDSFLSDSV ISDFKKISMY ANEFDSELLK TNENQEQDDL 
QLELINEKEE ND