More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2677 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  46.19 
 
 		 823 aa  689    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  43.52 
 
 		 855 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  44.21 
 
 		 848 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  43.94 
 
 		 857 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  45.59 
 
 		 812 aa  677    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  43.38 
 
 		 840 aa  642    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  41.34 
 
 		 864 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  45.59 
 
 		 893 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  43.14 
 
 		 878 aa  641    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  45.62 
 
 		 824 aa  691    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  46.32 
 
 		 823 aa  690    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  42.36 
 
 		 848 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  44.99 
 
 		 819 aa  683    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  44.11 
 
 		 827 aa  643    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  46.26 
 
 		 821 aa  707    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  46.32 
 
 		 823 aa  690    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  46.32 
 
 		 823 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  46.38 
 
 		 823 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2512  DNA gyrase subunit A  43.5 
 
 		 878 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0982635 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  42.77 
 
 		 863 aa  648    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  42.89 
 
 		 863 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  44.62 
 
 		 830 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  46.07 
 
 		 836 aa  686    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  44.82 
 
 		 808 aa  658    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  41.45 
 
 		 883 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  42.33 
 
 		 869 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  42.36 
 
 		 849 aa  642    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  43.32 
 
 		 856 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  46.27 
 
 		 827 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  43.66 
 
 		 823 aa  666    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  46.67 
 
 		 899 aa  695    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  43.57 
 
 		 828 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  45.45 
 
 		 835 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  43.07 
 
 		 875 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  44.77 
 
 		 815 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  44.86 
 
 		 828 aa  667    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  44.18 
 
 		 857 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  44.6 
 
 		 811 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  44.19 
 
 		 809 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  46.32 
 
 		 823 aa  690    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  47.13 
 
 		 807 aa  716    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1016  DNA gyrase, A subunit  42.44 
 
 		 845 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  46.07 
 
 		 836 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  45.87 
 
 		 807 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  45.43 
 
 		 814 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  46.73 
 
 		 816 aa  695    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  44.57 
 
 		 836 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  43.45 
 
 		 885 aa  649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  41.45 
 
 		 879 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2767  DNA gyrase subunit A  44.12 
 
 		 897 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  45.88 
 
 		 823 aa  687    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  46.12 
 
 		 823 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3019  DNA gyrase subunit A  43.14 
 
 		 877 aa  638    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.542004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  46.32 
 
 		 823 aa  690    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  43.65 
 
 		 812 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  44.88 
 
 		 830 aa  681    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  42.42 
 
 		 859 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  43.45 
 
 		 838 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0713  DNA gyrase subunit A  42.1 
 
 		 897 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  46.3 
 
 		 832 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  44.12 
 
 		 897 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  42.98 
 
 		 894 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  46.42 
 
 		 818 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  44.1 
 
 		 852 aa  682    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2457  DNA gyrase subunit A  43.5 
 
 		 878 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0910619  normal  0.208896 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 		 865 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  45.02 
 
 		 839 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  45.14 
 
 		 839 aa  695    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  43.8 
 
 		 878 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  44.86 
 
 		 828 aa  671    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  42.82 
 
 		 816 aa  654    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  46.96 
 
 		 825 aa  703    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  44.12 
 
 		 885 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  44 
 
 		 812 aa  652    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  43.9 
 
 		 889 aa  686    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  100 
 
 		 808 aa  1644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  43.29 
 
 		 836 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  45.54 
 
 		 866 aa  666    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1105  DNA gyrase subunit A  43.75 
 
 		 879 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0580579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  45.45 
 
 		 848 aa  675    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  45.31 
 
 		 817 aa  683    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  43.04 
 
 		 834 aa  642    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  43.82 
 
 		 823 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  45.6 
 
 		 796 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  45.09 
 
 		 813 aa  673    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  42.64 
 
 		 827 aa  648    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  43.82 
 
 		 826 aa  652    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  46.33 
 
 		 828 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2408  DNA gyrase subunit A  43.5 
 
 		 878 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000367831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  44.58 
 
 		 843 aa  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  43.99 
 
 		 827 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  46.25 
 
 		 823 aa  691    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2616  DNA gyrase subunit A  43.5 
 
 		 878 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.341614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  43.26 
 
 		 840 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3041  DNA gyrase subunit A  42.51 
 
 		 883 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.894078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  44.79 
 
 		 856 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  43.38 
 
 		 882 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  43.9 
 
 		 889 aa  686    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1539  DNA gyrase subunit A  42.36 
 
 		 850 aa  648    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.202951  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0894  DNA gyrase, A subunit  42.44 
 
 		 845 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>