More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1618 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  44.56 
 
 
823 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  44.19 
 
 
807 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  69.48 
 
 
807 aa  1154    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  58.97 
 
 
800 aa  964    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 
823 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  69.6 
 
 
807 aa  1154    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  43.53 
 
 
818 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  69.6 
 
 
807 aa  1155    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  55.61 
 
 
819 aa  845    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  42.56 
 
 
811 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 
823 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  69.73 
 
 
807 aa  1156    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 
823 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  69.73 
 
 
807 aa  1156    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  46.41 
 
 
908 aa  656    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  44.53 
 
 
823 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  69.73 
 
 
807 aa  1156    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  45.34 
 
 
818 aa  666    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  45.14 
 
 
827 aa  683    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  43.74 
 
 
823 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  42.57 
 
 
807 aa  647    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  44.12 
 
 
816 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  69.04 
 
 
807 aa  1124    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  69.16 
 
 
807 aa  1124    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  69.6 
 
 
807 aa  1154    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  40.8 
 
 
809 aa  636    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 
823 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  69.73 
 
 
807 aa  1156    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  79.43 
 
 
814 aa  1353    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  43.92 
 
 
823 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  70.61 
 
 
807 aa  1164    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  44.3 
 
 
823 aa  645    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  43.86 
 
 
809 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  44.02 
 
 
825 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
814 aa  1667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 
823 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  44.04 
 
 
839 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  44.17 
 
 
839 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  44.99 
 
 
821 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  58.05 
 
 
800 aa  932    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  58.05 
 
 
800 aa  932    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  44.61 
 
 
820 aa  689    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  53.03 
 
 
824 aa  846    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  52.04 
 
 
811 aa  767    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  54.45 
 
 
826 aa  877    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  50.5 
 
 
812 aa  814    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  54.03 
 
 
806 aa  847    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  53.27 
 
 
821 aa  838    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  43.92 
 
 
819 aa  635  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  44.88 
 
 
899 aa  634  1e-180  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  44.34 
 
 
824 aa  633  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  41.73 
 
 
878 aa  633  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  43.55 
 
 
836 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  44.01 
 
 
836 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  39.88 
 
 
856 aa  625  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  43.83 
 
 
893 aa  628  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  42.65 
 
 
875 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.06 
 
 
812 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  42.82 
 
 
824 aa  626  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  44.53 
 
 
823 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  41.79 
 
 
816 aa  624  1e-177  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  43.18 
 
 
832 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  42.82 
 
 
865 aa  624  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.82 
 
 
852 aa  625  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  41.37 
 
 
879 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  41.03 
 
 
826 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  43.62 
 
 
838 aa  619  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1105  DNA gyrase subunit A  41.25 
 
 
879 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0580579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  42.7 
 
 
899 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  43.55 
 
 
814 aa  619  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3019  DNA gyrase subunit A  41.13 
 
 
877 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.542004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  41.25 
 
 
882 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  43.07 
 
 
836 aa  619  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  41.32 
 
 
829 aa  620  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  42.62 
 
 
848 aa  620  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  41.53 
 
 
808 aa  621  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  41.63 
 
 
806 aa  617  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  41.31 
 
 
840 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  45.12 
 
 
802 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  43.28 
 
 
834 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  41.15 
 
 
828 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  42.52 
 
 
817 aa  616  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  41.21 
 
 
857 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  40.76 
 
 
894 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  44.22 
 
 
823 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  39.19 
 
 
893 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  42.02 
 
 
848 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1539  DNA gyrase subunit A  42.02 
 
 
850 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.202951  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0387  DNA gyrase, A subunit  41.28 
 
 
847 aa  613  9.999999999999999e-175  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  42.13 
 
 
889 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  40.67 
 
 
862 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  42.13 
 
 
889 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  41.64 
 
 
796 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  41.01 
 
 
897 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  39.88 
 
 
860 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  41.94 
 
 
835 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  41.08 
 
 
828 aa  609  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  41.11 
 
 
857 aa  612  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  40.3 
 
 
811 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  41.06 
 
 
828 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>