More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0926 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
800 aa  1627    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  57.86 
 
 
807 aa  925    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 
807 aa  932    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  52.98 
 
 
819 aa  813    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 
807 aa  932    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 
807 aa  932    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  45.16 
 
 
908 aa  642    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 
807 aa  932    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  56.98 
 
 
807 aa  907    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 
807 aa  932    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 
807 aa  932    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  52.01 
 
 
821 aa  799    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  42.71 
 
 
899 aa  637    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  56.02 
 
 
814 aa  943    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  58.97 
 
 
814 aa  969    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  83.23 
 
 
800 aa  1341    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  57.11 
 
 
807 aa  910    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  83.23 
 
 
800 aa  1341    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 
807 aa  932    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  50.25 
 
 
824 aa  802    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  50.21 
 
 
811 aa  746    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  51.45 
 
 
826 aa  839    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  47.32 
 
 
812 aa  766    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  52.84 
 
 
806 aa  828    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  57.36 
 
 
807 aa  928    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  42.6 
 
 
827 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  40.43 
 
 
809 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  44.09 
 
 
807 aa  623  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  43.93 
 
 
818 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  42.05 
 
 
820 aa  621  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  45.44 
 
 
979 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  45.44 
 
 
979 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  42.9 
 
 
821 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  44.06 
 
 
818 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  42.44 
 
 
816 aa  608  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.6 
 
 
852 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
839 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
839 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  40.1 
 
 
829 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 
823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  42.62 
 
 
823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  42.49 
 
 
823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  42.49 
 
 
823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  42.62 
 
 
823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  43.13 
 
 
825 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  42.16 
 
 
809 aa  599  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  39.39 
 
 
949 aa  602  1e-170  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 
823 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 
823 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 
823 aa  601  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 
823 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 
823 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  42.88 
 
 
848 aa  600  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  42.41 
 
 
809 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  39.8 
 
 
812 aa  595  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  41.98 
 
 
815 aa  595  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  41.17 
 
 
809 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  41.47 
 
 
809 aa  595  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  40.93 
 
 
811 aa  595  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  38.97 
 
 
848 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  44.11 
 
 
809 aa  594  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  42.23 
 
 
811 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  44.69 
 
 
893 aa  590  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  41.58 
 
 
814 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 
883 aa  592  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  41.91 
 
 
836 aa  592  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  43.37 
 
 
834 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  41.8 
 
 
901 aa  586  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  40.28 
 
 
807 aa  588  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  40.32 
 
 
852 aa  586  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  40.79 
 
 
813 aa  588  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  43.4 
 
 
819 aa  588  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  41.49 
 
 
814 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  41.47 
 
 
819 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  39.42 
 
 
899 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  40.19 
 
 
855 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  39.05 
 
 
838 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  38.61 
 
 
855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  41.87 
 
 
816 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  40.93 
 
 
875 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  39.04 
 
 
856 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  40.71 
 
 
836 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  38.55 
 
 
812 aa  581  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  41.75 
 
 
817 aa  580  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  41.39 
 
 
802 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  39.95 
 
 
833 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  38.99 
 
 
859 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  40.23 
 
 
838 aa  576  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.13 
 
 
828 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  40.26 
 
 
878 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  43.31 
 
 
889 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  40.08 
 
 
830 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  43.31 
 
 
889 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  40.57 
 
 
836 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  39.75 
 
 
878 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  43.17 
 
 
840 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  39.12 
 
 
885 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  41.22 
 
 
865 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  40.16 
 
 
808 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  39.56 
 
 
879 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>