More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf021 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  100 
 
 
949 aa  1919    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  41.41 
 
 
826 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  40.96 
 
 
814 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  40.29 
 
 
814 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  40.62 
 
 
807 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  40.88 
 
 
807 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  40.63 
 
 
807 aa  582  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 
807 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 
807 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 
807 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 
807 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  40.38 
 
 
807 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  40.5 
 
 
807 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  40.63 
 
 
807 aa  582  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  43.45 
 
 
811 aa  581  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  40.38 
 
 
807 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  39.92 
 
 
800 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  39.64 
 
 
800 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  39.92 
 
 
800 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  42.01 
 
 
824 aa  575  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  40.68 
 
 
908 aa  558  1e-157  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  40.42 
 
 
821 aa  554  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  40.76 
 
 
812 aa  551  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.35 
 
 
899 aa  548  1e-154  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  41.15 
 
 
819 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  38.14 
 
 
806 aa  535  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  38.52 
 
 
852 aa  531  1e-149  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  38.34 
 
 
855 aa  528  1e-148  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  36.76 
 
 
827 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  36.72 
 
 
807 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  36.86 
 
 
833 aa  476  1e-132  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  36.59 
 
 
809 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  34.52 
 
 
802 aa  475  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  36.4 
 
 
809 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  36.64 
 
 
809 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  36.33 
 
 
804 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  37.31 
 
 
814 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  35.96 
 
 
839 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  36.09 
 
 
839 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  36.19 
 
 
804 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  32.86 
 
 
870 aa  469  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  36.33 
 
 
816 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  35.23 
 
 
812 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  35.62 
 
 
820 aa  462  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  35.96 
 
 
818 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  37.26 
 
 
806 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  34.77 
 
 
828 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  34.62 
 
 
865 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  35.33 
 
 
829 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  34.82 
 
 
838 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  36.24 
 
 
816 aa  458  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  34.82 
 
 
821 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  36.42 
 
 
979 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  36.55 
 
 
979 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  34.38 
 
 
901 aa  454  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  32.88 
 
 
824 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  35.28 
 
 
809 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  35.67 
 
 
819 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  35.81 
 
 
818 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  34.34 
 
 
812 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  35.99 
 
 
817 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  35.18 
 
 
819 aa  450  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  35.32 
 
 
823 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  34.29 
 
 
827 aa  452  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  33.88 
 
 
832 aa  452  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  35.68 
 
 
811 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1238  DNA gyrase, A subunit  35.07 
 
 
813 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  34.68 
 
 
932 aa  452  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  34.64 
 
 
899 aa  450  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  34.21 
 
 
840 aa  450  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  36.73 
 
 
788 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  35.49 
 
 
815 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  34.28 
 
 
823 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  35.41 
 
 
834 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  33.05 
 
 
879 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  34.28 
 
 
823 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  34.15 
 
 
823 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  35.22 
 
 
859 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  34.35 
 
 
898 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0994  DNA gyrase, A subunit  33.84 
 
 
827 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  33.78 
 
 
866 aa  449  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  35.17 
 
 
808 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  33.24 
 
 
893 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  35.01 
 
 
836 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  36.16 
 
 
870 aa  446  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  34.01 
 
 
823 aa  446  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  34.42 
 
 
823 aa  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  34.01 
 
 
823 aa  446  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  34.01 
 
 
823 aa  446  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  34.1 
 
 
823 aa  446  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  34.87 
 
 
836 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  34.01 
 
 
823 aa  446  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  34.76 
 
 
814 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  35.96 
 
 
830 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  33.11 
 
 
893 aa  445  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  34.77 
 
 
823 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  34.07 
 
 
848 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  32.34 
 
 
852 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  34.15 
 
 
823 aa  445  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  34.08 
 
 
827 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>