More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0524 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  98.94 
 
 
855 aa  1706    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  100 
 
 
852 aa  1730    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.87 
 
 
899 aa  594  1e-168  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  40.36 
 
 
814 aa  588  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  40.05 
 
 
814 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  43.3 
 
 
824 aa  588  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  38.9 
 
 
807 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  42.19 
 
 
806 aa  582  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  41.42 
 
 
908 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 
826 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  40.32 
 
 
800 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  40.74 
 
 
800 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  40.74 
 
 
800 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 
807 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  41.17 
 
 
807 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  41.44 
 
 
807 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 
807 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  42.21 
 
 
819 aa  559  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 
807 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 
807 aa  561  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 
807 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 
807 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  41.03 
 
 
807 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  38.65 
 
 
807 aa  558  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  39.56 
 
 
821 aa  538  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  38.9 
 
 
812 aa  536  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  38.52 
 
 
949 aa  531  1e-149  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  40.11 
 
 
811 aa  531  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  36.02 
 
 
820 aa  499  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  38.1 
 
 
827 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  35.6 
 
 
804 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  36.52 
 
 
802 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  36.01 
 
 
839 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  35.2 
 
 
804 aa  489  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  35.88 
 
 
839 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  36.04 
 
 
828 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  36.11 
 
 
807 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  37.43 
 
 
807 aa  482  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  38.04 
 
 
814 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  35.26 
 
 
825 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  35.77 
 
 
818 aa  482  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  36.7 
 
 
809 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  36.76 
 
 
898 aa  474  1e-132  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  38.37 
 
 
870 aa  476  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  36.97 
 
 
811 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  35.73 
 
 
901 aa  471  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  37 
 
 
821 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  34.62 
 
 
812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  37.17 
 
 
834 aa  472  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  36.53 
 
 
829 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  36.1 
 
 
823 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  36.1 
 
 
823 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  36.1 
 
 
823 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  36.23 
 
 
823 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  36.1 
 
 
823 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  36.24 
 
 
823 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  36.1 
 
 
823 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  36.6 
 
 
899 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  36.1 
 
 
823 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  33.51 
 
 
848 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  35.3 
 
 
818 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  34.65 
 
 
809 aa  465  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  36.09 
 
 
823 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  36.09 
 
 
839 aa  465  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 
870 aa  463  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  36.3 
 
 
823 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  35.58 
 
 
819 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  37.55 
 
 
796 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  36.56 
 
 
932 aa  462  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  35.97 
 
 
893 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  36.33 
 
 
788 aa  461  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  34.99 
 
 
879 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  34.09 
 
 
814 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2770  DNA gyrase, A subunit  32.73 
 
 
823 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  34.05 
 
 
836 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  34.31 
 
 
836 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  35.89 
 
 
866 aa  460  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  35.86 
 
 
848 aa  461  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  36.89 
 
 
817 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  35.06 
 
 
816 aa  457  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  35.48 
 
 
832 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  34.87 
 
 
830 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  36.06 
 
 
949 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  35.29 
 
 
806 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  34.55 
 
 
816 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  34.55 
 
 
815 aa  452  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  34.21 
 
 
855 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1142  DNA gyrase subunit A  35.69 
 
 
858 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  34.73 
 
 
838 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  35.24 
 
 
816 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  33.46 
 
 
811 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0295  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  37.78 
 
 
748 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  33.5 
 
 
856 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  37.08 
 
 
979 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  37.08 
 
 
979 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  34.23 
 
 
812 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  36.51 
 
 
796 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  35.94 
 
 
809 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  35.49 
 
 
840 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  35.15 
 
 
838 aa  451  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>