More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1363 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  47.32 
 
 
800 aa  744    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  50.88 
 
 
807 aa  781    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  51.83 
 
 
819 aa  822    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  50.75 
 
 
807 aa  780    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  50.75 
 
 
807 aa  780    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  50.75 
 
 
807 aa  780    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  50.5 
 
 
807 aa  760    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  50.75 
 
 
807 aa  781    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  50.75 
 
 
807 aa  780    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  50.88 
 
 
807 aa  781    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  51.62 
 
 
807 aa  785    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  47.88 
 
 
800 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  50.5 
 
 
814 aa  801    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  47.88 
 
 
800 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  49.88 
 
 
814 aa  800    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  50.25 
 
 
807 aa  759    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  50.75 
 
 
807 aa  780    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  58.43 
 
 
821 aa  925    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  52.29 
 
 
824 aa  805    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  62.77 
 
 
811 aa  931    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  53.91 
 
 
826 aa  881    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
812 aa  1670    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  50.63 
 
 
806 aa  800    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  42.73 
 
 
908 aa  600  1e-170  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  41.7 
 
 
899 aa  598  1e-170  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  39.87 
 
 
807 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  38.65 
 
 
812 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.19 
 
 
809 aa  557  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  40.76 
 
 
949 aa  551  1e-155  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  37.8 
 
 
848 aa  548  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0524  DNA topoisomerase IV, A subunit  38.9 
 
 
852 aa  536  1e-151  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.72037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  38.26 
 
 
818 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0514  DNA topoisomerase IV, A subunit family protein  38.76 
 
 
855 aa  534  1e-150  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  38.15 
 
 
855 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  38.62 
 
 
856 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  39.81 
 
 
852 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  38.35 
 
 
820 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  40.13 
 
 
809 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.95 
 
 
807 aa  528  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  38.71 
 
 
809 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.46 
 
 
814 aa  527  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  39.67 
 
 
813 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  37.21 
 
 
893 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  36.67 
 
 
811 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  37.01 
 
 
833 aa  519  1e-146  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  40.35 
 
 
839 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  41.04 
 
 
979 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  40.65 
 
 
839 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  41.04 
 
 
979 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  38.06 
 
 
809 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.95 
 
 
821 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  37.87 
 
 
899 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.19 
 
 
808 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  37.87 
 
 
811 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  38.06 
 
 
809 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  38.29 
 
 
827 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  38.84 
 
 
823 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  38.97 
 
 
823 aa  515  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.97 
 
 
823 aa  515  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.84 
 
 
823 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  40.57 
 
 
848 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.7 
 
 
823 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.7 
 
 
823 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.7 
 
 
823 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  38.7 
 
 
823 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  36.75 
 
 
808 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.7 
 
 
823 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.7 
 
 
823 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  39.34 
 
 
870 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  38.26 
 
 
819 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  36.7 
 
 
816 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  36.5 
 
 
859 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  39.78 
 
 
812 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  38.6 
 
 
865 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  37.07 
 
 
838 aa  507  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  39.28 
 
 
804 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  38.23 
 
 
796 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  37.7 
 
 
818 aa  505  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  39.01 
 
 
804 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  37.47 
 
 
816 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  36.56 
 
 
889 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  36.56 
 
 
889 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  38.49 
 
 
901 aa  502  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  38.56 
 
 
836 aa  504  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  37.1 
 
 
859 aa  500  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  38.29 
 
 
825 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  36.88 
 
 
806 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  37.43 
 
 
836 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  37.16 
 
 
836 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  36.59 
 
 
846 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  36.64 
 
 
932 aa  497  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  37.26 
 
 
830 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  38.23 
 
 
840 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  38.15 
 
 
830 aa  499  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  39.24 
 
 
829 aa  498  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  38.45 
 
 
802 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  38.11 
 
 
835 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  36.42 
 
 
828 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  36.02 
 
 
828 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  39.17 
 
 
866 aa  493  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>