More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3284 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  56.98 
 
 
800 aa  924    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  95.42 
 
 
807 aa  1560    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  69.04 
 
 
814 aa  1148    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1153  DNA topoisomerase IV subunit A  51.36 
 
 
819 aa  799    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00798408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  92.57 
 
 
807 aa  1503    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  95.42 
 
 
807 aa  1560    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  95.42 
 
 
807 aa  1560    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl310  DNA topoisomerase IV subunit A  44.88 
 
 
908 aa  644    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  95.42 
 
 
807 aa  1560    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
807 aa  1639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  95.42 
 
 
807 aa  1560    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  94.8 
 
 
807 aa  1530    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  43.09 
 
 
818 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  95.29 
 
 
807 aa  1559    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  95.42 
 
 
807 aa  1560    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  43.81 
 
 
827 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  57.82 
 
 
800 aa  899    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  57.82 
 
 
800 aa  899    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  43 
 
 
807 aa  646    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0783  DNA topoisomerase IV subunit A  51.47 
 
 
821 aa  799    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.283848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  53.34 
 
 
824 aa  828    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  51.65 
 
 
811 aa  759    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  51.63 
 
 
826 aa  816    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1363  DNA topoisomerase IV subunit A  50.25 
 
 
812 aa  798    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0634  DNA topoisomerase IV subunit A  53.12 
 
 
806 aa  800    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  67.54 
 
 
814 aa  1136    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  95.04 
 
 
807 aa  1554    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  44.99 
 
 
816 aa  642    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  42.57 
 
 
820 aa  634  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  42.36 
 
 
811 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.54 
 
 
807 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  44.97 
 
 
818 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  44.17 
 
 
809 aa  626  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  44.67 
 
 
899 aa  628  1e-178  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  44.68 
 
 
839 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  44.81 
 
 
839 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  41.82 
 
 
811 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  42 
 
 
852 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  41.91 
 
 
893 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  43.42 
 
 
814 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  40.82 
 
 
829 aa  618  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  41.64 
 
 
823 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  42.19 
 
 
825 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 
823 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 
823 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 
823 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  41.59 
 
 
823 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 
823 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 
821 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  41.34 
 
 
823 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 
823 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  41.22 
 
 
823 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 
823 aa  608  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf021  topoiosmerase IV subunit A  40.88 
 
 
949 aa  611  1e-173  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.842313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  42.84 
 
 
865 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  41.67 
 
 
819 aa  608  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  40.12 
 
 
809 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  41.92 
 
 
824 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  42.23 
 
 
832 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  42.52 
 
 
828 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  42.27 
 
 
836 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  42.17 
 
 
802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  42.69 
 
 
840 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  42.27 
 
 
836 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.3 
 
 
828 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  41.17 
 
 
889 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  41.17 
 
 
889 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  45.18 
 
 
979 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  45.18 
 
 
979 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  42.82 
 
 
848 aa  600  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  42.3 
 
 
878 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  40.98 
 
 
899 aa  596  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  44.15 
 
 
812 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  41.67 
 
 
812 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  40.25 
 
 
836 aa  597  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  42.05 
 
 
827 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  41.96 
 
 
823 aa  595  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  42.56 
 
 
819 aa  593  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  41.76 
 
 
827 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  40.86 
 
 
812 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  41.34 
 
 
878 aa  591  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  43.55 
 
 
870 aa  591  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  40.77 
 
 
834 aa  589  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1105  DNA gyrase subunit A  42.42 
 
 
879 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0580579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  40.52 
 
 
840 aa  586  1e-166  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  40.43 
 
 
856 aa  587  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  43.03 
 
 
835 aa  588  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  40.96 
 
 
857 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  42.16 
 
 
879 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  39.48 
 
 
830 aa  588  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3019  DNA gyrase subunit A  42.05 
 
 
877 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.542004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  40.78 
 
 
826 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  41.04 
 
 
828 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  40.83 
 
 
857 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  41.21 
 
 
824 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  41.41 
 
 
838 aa  583  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  41.45 
 
 
870 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  39.77 
 
 
932 aa  583  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  39.76 
 
 
894 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  40.75 
 
 
885 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>