More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2039 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  99.39 
 
 
979 aa  1963    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
979 aa  1972    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  43.25 
 
 
828 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  45.49 
 
 
820 aa  607  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  43.77 
 
 
814 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0926  DNA topoisomerase IV subunit A  45.44 
 
 
800 aa  605  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.485953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2246  DNA topoisomerase IV subunit A  45.73 
 
 
807 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  45.62 
 
 
818 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  46.21 
 
 
814 aa  598  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  46.41 
 
 
800 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000310751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1444  DNA topoisomerase IV subunit A  46.41 
 
 
800 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000125144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  44.98 
 
 
814 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  46.8 
 
 
839 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  46.94 
 
 
839 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  45.39 
 
 
807 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  45.53 
 
 
807 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  45.53 
 
 
807 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  45.53 
 
 
807 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  45.39 
 
 
807 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  45.53 
 
 
807 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 
852 aa  592  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  45.67 
 
 
807 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  44.33 
 
 
807 aa  588  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  44.8 
 
 
811 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  45.39 
 
 
807 aa  589  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  44.35 
 
 
809 aa  589  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  45.52 
 
 
827 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  45.3 
 
 
821 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  46.2 
 
 
807 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  45.32 
 
 
807 aa  582  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
823 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  44.87 
 
 
823 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  44.29 
 
 
825 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  45.18 
 
 
807 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  45.51 
 
 
883 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  43.84 
 
 
802 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  45.01 
 
 
823 aa  579  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  44.48 
 
 
816 aa  582  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  44.34 
 
 
893 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  44.61 
 
 
932 aa  577  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  44.73 
 
 
823 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  44.68 
 
 
818 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  43.42 
 
 
899 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  43.81 
 
 
816 aa  566  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  43.04 
 
 
901 aa  565  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  44.68 
 
 
819 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  41.99 
 
 
889 aa  562  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  42.19 
 
 
809 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  41.99 
 
 
889 aa  562  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  42.05 
 
 
893 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  43.08 
 
 
828 aa  556  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  41.94 
 
 
812 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  39.75 
 
 
836 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  43.52 
 
 
808 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  44.88 
 
 
840 aa  555  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  39.75 
 
 
836 aa  555  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  44.37 
 
 
848 aa  554  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  41.91 
 
 
893 aa  555  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  42.82 
 
 
838 aa  553  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  42.11 
 
 
827 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  41.9 
 
 
827 aa  552  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  40.97 
 
 
898 aa  551  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  43.5 
 
 
814 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  42.9 
 
 
870 aa  550  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  42.37 
 
 
865 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  43.72 
 
 
796 aa  551  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  41.23 
 
 
815 aa  548  1e-154  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  43.69 
 
 
819 aa  548  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  39.31 
 
 
832 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  42.4 
 
 
869 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  42.72 
 
 
813 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  40.97 
 
 
904 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1070  DNA topoisomerase IV subunit A  41.41 
 
 
824 aa  546  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  43.04 
 
 
829 aa  549  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  41.78 
 
 
815 aa  543  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  41.5 
 
 
894 aa  544  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  39.45 
 
 
855 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  44.52 
 
 
870 aa  544  1e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  45.22 
 
 
875 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  42.63 
 
 
826 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  42.8 
 
 
817 aa  543  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  40.81 
 
 
860 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  43.33 
 
 
879 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  43.13 
 
 
898 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  40.82 
 
 
835 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  41.91 
 
 
809 aa  542  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  42 
 
 
853 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  42.03 
 
 
885 aa  540  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  42.01 
 
 
878 aa  542  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  40.41 
 
 
856 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  41.63 
 
 
809 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  41.39 
 
 
811 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  35.65 
 
 
856 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  40.58 
 
 
811 aa  539  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>