More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2135 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2135  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 787 aa  1600    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.76 
 
 		 775 aa  758    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0106  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.27 
 
 		 781 aa  680    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  40.08 
 
 		 865 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  40.05 
 
 		 825 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  40.05 
 
 		 818 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  39.95 
 
 		 754 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.27 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.14 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.41 
 
 		 823 aa  511  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 		 802 aa  510  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  38.76 
 
 		 875 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.27 
 
 		 823 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  40.31 
 
 		 809 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.27 
 
 		 823 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.27 
 
 		 823 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.27 
 
 		 823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.27 
 
 		 823 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.48 
 
 		 807 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  39.38 
 
 		 804 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  40.24 
 
 		 852 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  39.38 
 
 		 804 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.85 
 
 		 807 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  41.48 
 
 		 812 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  39.41 
 
 		 901 aa  504  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 823 aa  505  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  39.22 
 
 		 796 aa  504  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 		 820 aa  502  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  38.95 
 
 		 828 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  37.55 
 
 		 869 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40.8 
 
 		 809 aa  497  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  39 
 
 		 870 aa  496  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  39.49 
 
 		 827 aa  496  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  40.88 
 
 		 932 aa  499  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  39.25 
 
 		 893 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  39.67 
 
 		 815 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  38.68 
 
 		 828 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  39.05 
 
 		 821 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  40.8 
 
 		 809 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  38.33 
 
 		 836 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  36.62 
 
 		 865 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1238  DNA gyrase, A subunit  37.86 
 
 		 813 aa  494  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  38.16 
 
 		 836 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  38.6 
 
 		 812 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  38.04 
 
 		 816 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  39.57 
 
 		 889 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  38.48 
 
 		 832 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  39.57 
 
 		 889 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  39.76 
 
 		 839 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  40.51 
 
 		 809 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  41 
 
 		 823 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  38.59 
 
 		 815 aa  487  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  38.52 
 
 		 838 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.62 
 
 		 814 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  38.52 
 
 		 828 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  37.32 
 
 		 853 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  39.28 
 
 		 816 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  42.56 
 
 		 750 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  39.62 
 
 		 839 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  38.32 
 
 		 827 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  39.38 
 
 		 813 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  38.52 
 
 		 827 aa  489  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  42.4 
 
 		 913 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  39.27 
 
 		 809 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  40.39 
 
 		 823 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  38.76 
 
 		 855 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  41.16 
 
 		 824 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  37.89 
 
 		 883 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  39.19 
 
 		 811 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  38.93 
 
 		 805 aa  482  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl007  DNA gyrase subunit A  36.25 
 
 		 825 aa  481  1e-134  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  38.9 
 
 		 872 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  43.33 
 
 		 835 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  39.27 
 
 		 864 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  38.29 
 
 		 806 aa  481  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  37.5 
 
 		 819 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.35 
 
 		 809 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  38.37 
 
 		 808 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  36.72 
 
 		 828 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  37.76 
 
 		 857 aa  479  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  42.11 
 
 		 913 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  40.63 
 
 		 827 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  36.63 
 
 		 818 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 834 aa  477  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  38.02 
 
 		 857 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  37.89 
 
 		 811 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 871 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  37.24 
 
 		 848 aa  479  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  37.62 
 
 		 830 aa  477  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  41.97 
 
 		 915 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  36.81 
 
 		 814 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  37.92 
 
 		 949 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  39.38 
 
 		 856 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  36.56 
 
 		 826 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 898 aa  475  1e-132  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  39.89 
 
 		 913 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  39.36 
 
 		 865 aa  475  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  36.32 
 
 		 838 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  39.68 
 
 		 811 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>