More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl007 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  43.34 
 
 		 875 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  43.1 
 
 		 875 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2799  DNA gyrase subunit A  43.22 
 
 		 888 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107498  normal  0.540526 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  45.42 
 
 		 809 aa  682    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  42.86 
 
 		 857 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2860  DNA gyrase, A subunit  42.98 
 
 		 896 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120458  decreased coverage  0.000000000549862 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  44.38 
 
 		 859 aa  671    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  49.94 
 
 		 821 aa  783    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  47.18 
 
 		 893 aa  758    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  42.15 
 
 		 860 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  41.09 
 
 		 885 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  50.5 
 
 		 823 aa  787    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  47.45 
 
 		 807 aa  744    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1171  DNA gyrase subunit A  44.78 
 
 		 862 aa  651    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  46.05 
 
 		 819 aa  716    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  47.55 
 
 		 807 aa  723    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  42.36 
 
 		 824 aa  643    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  50.5 
 
 		 823 aa  787    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  50.5 
 
 		 823 aa  787    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl007  DNA gyrase subunit A  100 
 
 		 825 aa  1672    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  50.63 
 
 		 823 aa  787    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  41.54 
 
 		 893 aa  637    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  42.15 
 
 		 863 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  42.05 
 
 		 863 aa  653    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  42.8 
 
 		 811 aa  647    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  45.32 
 
 		 816 aa  703    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  42.03 
 
 		 848 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  43.75 
 
 		 832 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2606  DNA gyrase subunit A  43.22 
 
 		 875 aa  653    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  41.56 
 
 		 883 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  45.19 
 
 		 949 aa  688    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  43.98 
 
 		 818 aa  690    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  44.81 
 
 		 879 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  45.56 
 
 		 812 aa  719    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1459  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 873 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  44.08 
 
 		 834 aa  694    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  45.12 
 
 		 835 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1539  DNA gyrase subunit A  42.16 
 
 		 850 aa  640    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.202951  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  42.93 
 
 		 815 aa  659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  43.36 
 
 		 828 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  43.86 
 
 		 828 aa  676    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 		 857 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  42.32 
 
 		 811 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  42.35 
 
 		 871 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  50.5 
 
 		 823 aa  787    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  42.82 
 
 		 856 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2526  DNA gyrase subunit A  43.22 
 
 		 875 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0040  DNA gyrase, A subunit  77.23 
 
 		 795 aa  1261    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  43.88 
 
 		 814 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  45.28 
 
 		 899 aa  680    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  40.89 
 
 		 856 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2767  DNA gyrase subunit A  42.37 
 
 		 897 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.58 
 
 		 904 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  50.38 
 
 		 823 aa  785    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  45.92 
 
 		 889 aa  739    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  41.27 
 
 		 864 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  43.46 
 
 		 894 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  42.74 
 
 		 882 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1948  DNA gyrase, A subunit  41.29 
 
 		 908 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000559672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  44.46 
 
 		 830 aa  670    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  40.82 
 
 		 907 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  47.07 
 
 		 827 aa  722    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  42.37 
 
 		 885 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2070  DNA gyrase, A subunit  41.22 
 
 		 917 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2379  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 875 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.076856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  43.52 
 
 		 852 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1949  DNA gyrase, A subunit  42.29 
 
 		 879 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0708311  hitchhiker  0.00786865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  44.08 
 
 		 865 aa  688    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  47 
 
 		 839 aa  734    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  47 
 
 		 839 aa  734    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2067  DNA gyrase, A subunit  41.51 
 
 		 903 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  42.37 
 
 		 897 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1420  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 875 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 		 862 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  45.92 
 
 		 889 aa  739    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  47.13 
 
 		 812 aa  708    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  43.88 
 
 		 830 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1046  DNA gyrase subunit A  44.78 
 
 		 862 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  46.97 
 
 		 836 aa  722    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  46.48 
 
 		 866 aa  722    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  44.03 
 
 		 829 aa  702    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  46.59 
 
 		 848 aa  720    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  45.5 
 
 		 817 aa  711    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2306  DNA gyrase, A subunit  41.46 
 
 		 905 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0379216  hitchhiker  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  43.7 
 
 		 823 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  44.58 
 
 		 796 aa  679    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  44.03 
 
 		 813 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2371  DNA gyrase subunit A  43.46 
 
 		 875 aa  655    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  41.66 
 
 		 893 aa  637    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 		 878 aa  678    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1462  DNA gyrase subunit A  43.75 
 
 		 862 aa  644    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  42.87 
 
 		 843 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  43.23 
 
 		 827 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  43.28 
 
 		 827 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  43.45 
 
 		 823 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  44.11 
 
 		 856 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  43.56 
 
 		 856 aa  666    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  43.62 
 
 		 848 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  45.05 
 
 		 809 aa  677    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0761  DNA gyrase subunit A  44.66 
 
 		 862 aa  651    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000813267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>