More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0040 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  43.08 
 
 		 875 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  42.96 
 
 		 875 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  43.58 
 
 		 809 aa  653    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  42.91 
 
 		 857 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2616  DNA gyrase subunit A  43.8 
 
 		 878 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.341614 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  44.42 
 
 		 859 aa  656    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0088  DNA gyrase subunit A  47.11 
 
 		 844 aa  698    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  46.43 
 
 		 893 aa  728    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  42.38 
 
 		 860 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  43.26 
 
 		 897 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  50.32 
 
 		 823 aa  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2331  DNA gyrase, A subunit  41.2 
 
 		 908 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.627723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  50.32 
 
 		 823 aa  763    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  46.8 
 
 		 819 aa  719    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3365  DNA gyrase subunit A  43.08 
 
 		 875 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2408  DNA gyrase subunit A  43.8 
 
 		 878 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000367831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  50.32 
 
 		 823 aa  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  50.32 
 
 		 823 aa  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl007  DNA gyrase subunit A  77.23 
 
 		 825 aa  1293    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  50.32 
 
 		 823 aa  763    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  46.37 
 
 		 834 aa  701    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0894  DNA gyrase, A subunit  42.08 
 
 		 845 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  46.62 
 
 		 828 aa  719    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  46.17 
 
 		 889 aa  725    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  45.49 
 
 		 832 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  44.48 
 
 		 848 aa  689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  49.3 
 
 		 821 aa  756    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  41.47 
 
 		 812 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  44.44 
 
 		 949 aa  655    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  42.2 
 
 		 826 aa  643    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1539  DNA gyrase subunit A  41.9 
 
 		 850 aa  643    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.202951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  50.06 
 
 		 823 aa  761    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  44.6 
 
 		 816 aa  676    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  42.78 
 
 		 830 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1420  DNA gyrase subunit A  42.84 
 
 		 875 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  44.9 
 
 		 835 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2512  DNA gyrase subunit A  43.8 
 
 		 878 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0982635 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  41.76 
 
 		 815 aa  638    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  41.76 
 
 		 828 aa  651    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  42.87 
 
 		 857 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2457  DNA gyrase subunit A  43.8 
 
 		 878 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0910619  normal  0.208896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  43.48 
 
 		 808 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  50.32 
 
 		 823 aa  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  41.33 
 
 		 856 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  42.03 
 
 		 848 aa  643    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  44.89 
 
 		 836 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0040  DNA gyrase, A subunit  100 
 
 		 795 aa  1602    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  43.79 
 
 		 814 aa  667    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  42.77 
 
 		 894 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  47.64 
 
 		 807 aa  724    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2371  DNA gyrase subunit A  43.2 
 
 		 875 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  45.65 
 
 		 818 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  41.63 
 
 		 828 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1949  DNA gyrase, A subunit  42.42 
 
 		 879 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0708311  hitchhiker  0.00786865 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  44.87 
 
 		 812 aa  699    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  43.77 
 
 		 885 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2379  DNA gyrase subunit A  42.84 
 
 		 875 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.076856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  41.76 
 
 		 882 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  50.06 
 
 		 823 aa  762    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  44.33 
 
 		 830 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  41.17 
 
 		 907 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2767  DNA gyrase subunit A  43.26 
 
 		 897 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2067  DNA gyrase, A subunit  41.57 
 
 		 903 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  43.26 
 
 		 885 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  46.98 
 
 		 827 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2799  DNA gyrase subunit A  42.48 
 
 		 888 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107498  normal  0.540526 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 		 852 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  50.32 
 
 		 823 aa  765    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  44.57 
 
 		 865 aa  675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  46.23 
 
 		 839 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  45.98 
 
 		 839 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  50.45 
 
 		 823 aa  767    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  45.08 
 
 		 898 aa  656    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  41.69 
 
 		 828 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  41.48 
 
 		 862 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  44.46 
 
 		 878 aa  674    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  47.51 
 
 		 812 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  45.76 
 
 		 899 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  44.03 
 
 		 879 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  47.57 
 
 		 836 aa  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  46.04 
 
 		 866 aa  698    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  44.76 
 
 		 829 aa  691    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  47.24 
 
 		 848 aa  721    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  47.51 
 
 		 817 aa  721    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  46.17 
 
 		 889 aa  725    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2860  DNA gyrase, A subunit  42.57 
 
 		 896 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120458  decreased coverage  0.000000000549862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  43.57 
 
 		 796 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  42.67 
 
 		 813 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2526  DNA gyrase subunit A  42.96 
 
 		 875 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2498  DNA gyrase subunit A  43.56 
 
 		 878 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  43.34 
 
 		 811 aa  652    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2606  DNA gyrase subunit A  42.96 
 
 		 875 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  43.7 
 
 		 843 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  42.4 
 
 		 827 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  46.85 
 
 		 807 aa  705    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  42.49 
 
 		 856 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  42.51 
 
 		 856 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.16 
 
 		 904 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155743 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1016  DNA gyrase, A subunit  42.08 
 
 		 845 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  43.07 
 
 		 809 aa  651    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>