More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11750 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 875 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  40.61 
 
 		 875 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 		 823 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  44.15 
 
 		 809 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  41.4 
 
 		 857 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  43.09 
 
 		 855 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  43.33 
 
 		 836 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  43.66 
 
 		 832 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  42.63 
 
 		 893 aa  667    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  41.2 
 
 		 860 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  44.32 
 
 		 809 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  44.31 
 
 		 823 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  43.03 
 
 		 840 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  42.06 
 
 		 819 aa  651    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  41.63 
 
 		 827 aa  635    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 885 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  44.98 
 
 		 821 aa  706    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  44.31 
 
 		 823 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  44.31 
 
 		 823 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  41.5 
 
 		 889 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  44.5 
 
 		 823 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2526  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 875 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  44.31 
 
 		 823 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  43.11 
 
 		 828 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2512  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 878 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0982635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  44.75 
 
 		 823 aa  699    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  39.72 
 
 		 885 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2379  DNA gyrase subunit A  40.61 
 
 		 875 aa  643    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.076856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  41.71 
 
 		 949 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  41.52 
 
 		 848 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  42.23 
 
 		 879 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  41.21 
 
 		 872 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  41.85 
 
 		 823 aa  651    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  41.12 
 
 		 864 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2408  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 878 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000367831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  44.27 
 
 		 835 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  41.32 
 
 		 834 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  42.14 
 
 		 812 aa  653    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  41.26 
 
 		 828 aa  650    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  40.58 
 
 		 857 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  43.8 
 
 		 811 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  40.76 
 
 		 871 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  44.31 
 
 		 823 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2371  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 875 aa  646    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  42.96 
 
 		 856 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2606  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 875 aa  645    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  43.88 
 
 		 899 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3365  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 875 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  46.12 
 
 		 814 aa  698    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  42.52 
 
 		 828 aa  662    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  41.5 
 
 		 889 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  44.75 
 
 		 823 aa  697    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  41.72 
 
 		 857 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  41.78 
 
 		 839 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1539  DNA gyrase subunit A  40.61 
 
 		 850 aa  639    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.202951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  46.37 
 
 		 827 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  44.38 
 
 		 818 aa  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2498  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 878 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2616  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 878 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.341614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 		 823 aa  696    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  40.61 
 
 		 848 aa  640    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  42.89 
 
 		 830 aa  654    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  42.91 
 
 		 830 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  41.72 
 
 		 828 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  40.47 
 
 		 882 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  46.25 
 
 		 807 aa  712    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  43.3 
 
 		 824 aa  665    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  100 
 
 		 796 aa  1614    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  42 
 
 		 809 aa  636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2767  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 897 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.79 
 
 		 852 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2470  DNA gyrase, A subunit  40.42 
 
 		 897 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  41.17 
 
 		 856 aa  667    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  43.11 
 
 		 865 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 		 839 aa  687    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  44.43 
 
 		 839 aa  687    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  44.95 
 
 		 809 aa  638    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  46.09 
 
 		 816 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  43.65 
 
 		 816 aa  647    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  41.64 
 
 		 853 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  41.03 
 
 		 862 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  45.94 
 
 		 807 aa  726    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  42.24 
 
 		 812 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  44.76 
 
 		 823 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.67 
 
 		 812 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  42.86 
 
 		 836 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  40.26 
 
 		 878 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  41.96 
 
 		 829 aa  645    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  43.02 
 
 		 848 aa  654    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  41.71 
 
 		 817 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 897 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  45.47 
 
 		 796 aa  718    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  43.34 
 
 		 813 aa  668    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  46.14 
 
 		 808 aa  677    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1420  DNA gyrase subunit A  40.61 
 
 		 875 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  41.41 
 
 		 811 aa  645    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2457  DNA gyrase subunit A  40 
 
 		 878 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0910619  normal  0.208896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  40.75 
 
 		 843 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  42.15 
 
 		 827 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  42.32 
 
 		 838 aa  636    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>