More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2118 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 703 aa  1420    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  47.69 
 
 		 626 aa  577  1.0000000000000001e-163  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  45.69 
 
 		 914 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  40.98 
 
 		 846 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  40.92 
 
 		 897 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  41.88 
 
 		 859 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  43.15 
 
 		 864 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.43 
 
 		 708 aa  478  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  43.41 
 
 		 832 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.98 
 
 		 697 aa  464  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.44 
 
 		 904 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  41.48 
 
 		 906 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  39.21 
 
 		 977 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  37.15 
 
 		 898 aa  417  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  42.34 
 
 		 490 aa  362  1e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  36.98 
 
 		 923 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  36.98 
 
 		 922 aa  206  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  35.08 
 
 		 928 aa  206  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  36.98 
 
 		 934 aa  206  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  31.71 
 
 		 831 aa  201  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  32.54 
 
 		 835 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  29.22 
 
 		 822 aa  200  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  32.54 
 
 		 843 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  31.8 
 
 		 788 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  29.91 
 
 		 809 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  37.98 
 
 		 912 aa  196  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  31.88 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1241  DNA gyrase subunit A  34.52 
 
 		 931 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.998227  normal  0.707625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  36.01 
 
 		 907 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  36.01 
 
 		 907 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  36.01 
 
 		 904 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  30.8 
 
 		 839 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  31.36 
 
 		 899 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  35.89 
 
 		 913 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  34.38 
 
 		 855 aa  193  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  30.96 
 
 		 806 aa  193  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  30.59 
 
 		 839 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  31.09 
 
 		 834 aa  192  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2494  DNA gyrase subunit A  38.28 
 
 		 919 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  0.164499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2386  DNA gyrase subunit A  36.09 
 
 		 930 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380796  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0371  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.73 
 
 		 766 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  37.09 
 
 		 915 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0958  DNA gyrase, A subunit  33.88 
 
 		 869 aa  191  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.687987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  31.34 
 
 		 853 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  35.07 
 
 		 913 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2677  DNA gyrase, A subunit  30.15 
 
 		 808 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0557902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  30.87 
 
 		 848 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  29.78 
 
 		 852 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  33.51 
 
 		 900 aa  191  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl007  DNA gyrase subunit A  35.36 
 
 		 825 aa  190  5.999999999999999e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  35.61 
 
 		 927 aa  190  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4563  DNA gyrase subunit A  33.8 
 
 		 936 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  30.82 
 
 		 807 aa  190  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  32.43 
 
 		 888 aa  190  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 902 aa  189  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000857491  decreased coverage  3.4629599999999997e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1744  DNA gyrase subunit A  35.8 
 
 		 941 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494976  normal  0.4202 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  31.81 
 
 		 848 aa  190  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  32.31 
 
 		 828 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1396  DNA gyrase subunit A  33.24 
 
 		 877 aa  189  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.431905  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1633  DNA gyrase, A subunit  31.05 
 
 		 829 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0894525  normal  0.0126179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  33.42 
 
 		 812 aa  189  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1000  DNA topoisomerase IV subunit A  27.97 
 
 		 826 aa  189  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.925836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  32.85 
 
 		 915 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.11 
 
 		 828 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0306  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  32.21 
 
 		 727 aa  188  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000446008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  32.08 
 
 		 922 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  30.25 
 
 		 829 aa  188  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0007  DNA gyrase subunit A  29.42 
 
 		 922 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.45 
 
 		 848 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  29.51 
 
 		 820 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  29.93 
 
 		 824 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  31.03 
 
 		 856 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2464  DNA gyrase subunit A  32.97 
 
 		 888 aa  187  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4317  DNA topoisomerase IV subunit A  34.7 
 
 		 748 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  32.35 
 
 		 875 aa  187  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  32.87 
 
 		 796 aa  187  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  34.41 
 
 		 828 aa  187  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  33.85 
 
 		 841 aa  187  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  33.06 
 
 		 965 aa  187  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0295  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  32.84 
 
 		 748 aa  187  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0658  DNA gyrase, A subunit  32.51 
 
 		 830 aa  187  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  29.72 
 
 		 870 aa  187  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  29.48 
 
 		 898 aa  186  9e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1930  DNA gyrase subunit A  35.5 
 
 		 945 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  29.71 
 
 		 827 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3119  DNA gyrase subunit A  33.51 
 
 		 914 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  35.22 
 
 		 793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  32.16 
 
 		 753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  33.25 
 
 		 809 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  33.06 
 
 		 745 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  28.99 
 
 		 841 aa  186  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  34.91 
 
 		 911 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  32.5 
 
 		 819 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.17 
 
 		 775 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  34.84 
 
 		 752 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  32.43 
 
 		 880 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  32.62 
 
 		 830 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  30.51 
 
 		 979 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  32.08 
 
 		 910 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  34.11 
 
 		 880 aa  185  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>