More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0929 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  42.86 
 
 		 857 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  42.98 
 
 		 875 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  49.14 
 
 		 829 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  41.86 
 
 		 872 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  45.29 
 
 		 827 aa  683    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  58.19 
 
 		 835 aa  968    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  42.67 
 
 		 872 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  57.76 
 
 		 835 aa  976    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  41.15 
 
 		 869 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  49.42 
 
 		 806 aa  692    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  50.25 
 
 		 822 aa  717    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  41.9 
 
 		 865 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  42.87 
 
 		 863 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  42.65 
 
 		 856 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  52.61 
 
 		 858 aa  832    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  43.04 
 
 		 881 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  67.13 
 
 		 843 aa  1152    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  42.58 
 
 		 865 aa  651    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  44.89 
 
 		 828 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  42.15 
 
 		 812 aa  652    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  43.06 
 
 		 865 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  41.95 
 
 		 863 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  41.01 
 
 		 839 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  41.13 
 
 		 839 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  55.53 
 
 		 873 aa  932    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  41.76 
 
 		 885 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  42.86 
 
 		 872 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  45.35 
 
 		 827 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  42.86 
 
 		 857 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 848 aa  1726    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  67.22 
 
 		 835 aa  1142    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  54.9 
 
 		 839 aa  907    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  43.67 
 
 		 864 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  43.38 
 
 		 853 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  41.18 
 
 		 802 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  40.84 
 
 		 820 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  41.11 
 
 		 807 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  41.92 
 
 		 886 aa  625  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.17 
 
 		 816 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.37 
 
 		 814 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  40 
 
 		 811 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  39.42 
 
 		 825 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.83 
 
 		 818 aa  612  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  43.84 
 
 		 813 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  41.21 
 
 		 826 aa  608  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.54 
 
 		 823 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  39.43 
 
 		 807 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.54 
 
 		 823 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 		 823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  38.78 
 
 		 823 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 		 823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 		 823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 		 823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 		 823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  38.18 
 
 		 818 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.07 
 
 		 821 aa  601  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 		 823 aa  602  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  43.12 
 
 		 813 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 		 823 aa  602  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  40.09 
 
 		 819 aa  600  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  40.86 
 
 		 827 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  40.02 
 
 		 828 aa  596  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  39.27 
 
 		 832 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  38.19 
 
 		 828 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  39.31 
 
 		 809 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  38.54 
 
 		 836 aa  592  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  39.43 
 
 		 828 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  40.05 
 
 		 816 aa  593  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  39.19 
 
 		 828 aa  592  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  41.37 
 
 		 813 aa  592  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 		 808 aa  592  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  39.26 
 
 		 835 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  40.67 
 
 		 815 aa  589  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  38.75 
 
 		 827 aa  591  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  38.31 
 
 		 836 aa  588  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  46.17 
 
 		 813 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  39.93 
 
 		 809 aa  588  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  41.66 
 
 		 827 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  39.07 
 
 		 853 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  38.68 
 
 		 823 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  38 
 
 		 857 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  38.42 
 
 		 809 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  40.29 
 
 		 824 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  37.77 
 
 		 857 aa  582  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  38.53 
 
 		 814 aa  579  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  38 
 
 		 901 aa  578  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  37.73 
 
 		 864 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  38.6 
 
 		 899 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  39.24 
 
 		 852 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  37.29 
 
 		 860 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  39.16 
 
 		 866 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  38.44 
 
 		 823 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  39.74 
 
 		 796 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  38.59 
 
 		 897 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2888  DNA gyrase subunit A  38.66 
 
 		 866 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0953  DNA gyrase subunit A  38.66 
 
 		 866 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  38.66 
 
 		 866 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2578  DNA gyrase subunit A  38.66 
 
 		 888 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  37.99 
 
 		 848 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  39.74 
 
 		 813 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>