More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0825 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  48.56 
 
 		 898 aa  794    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 832 aa  1709    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  52.89 
 
 		 897 aa  861    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  52.54 
 
 		 864 aa  854    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  60.07 
 
 		 914 aa  1058    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.23 
 
 		 708 aa  672    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.28 
 
 		 697 aa  701    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  53.57 
 
 		 906 aa  887    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  53.61 
 
 		 977 aa  902    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  54.8 
 
 		 846 aa  958    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  57.18 
 
 		 859 aa  1019    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.74 
 
 		 904 aa  1006    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  43.41 
 
 		 703 aa  470  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  38.17 
 
 		 626 aa  458  1e-127  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  40.76 
 
 		 490 aa  332  2e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  33.89 
 
 		 923 aa  218  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  30.8 
 
 		 834 aa  213  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  34.29 
 
 		 922 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  36.87 
 
 		 922 aa  212  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  36.87 
 
 		 934 aa  210  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  34.29 
 
 		 923 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  34.29 
 
 		 921 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  34.29 
 
 		 919 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  34.03 
 
 		 910 aa  207  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1374  DNA gyrase subunit A  34.03 
 
 		 923 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  35.08 
 
 		 904 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  30.58 
 
 		 819 aa  205  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  34.64 
 
 		 907 aa  205  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  36.31 
 
 		 848 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  30.12 
 
 		 833 aa  204  5e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  32.64 
 
 		 775 aa  204  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  36.09 
 
 		 898 aa  204  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  32.36 
 
 		 796 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  34.56 
 
 		 928 aa  203  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  33.05 
 
 		 883 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1745  DNA gyrase, subunit A  33.51 
 
 		 928 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.6885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3647  DNA gyrase subunit A  33.77 
 
 		 925 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  29.45 
 
 		 853 aa  202  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5027  DNA gyrase, A subunit  32.44 
 
 		 911 aa  202  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.0567458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  32.44 
 
 		 911 aa  202  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  34.03 
 
 		 887 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  33.78 
 
 		 817 aa  200  9e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  36.05 
 
 		 750 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  35.88 
 
 		 893 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  33.33 
 
 		 911 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  34.9 
 
 		 806 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2386  DNA gyrase subunit A  31.8 
 
 		 930 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380796  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  35.88 
 
 		 893 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  36.06 
 
 		 913 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1114  DNA gyrase, A subunit  33.78 
 
 		 898 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37334 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  32.33 
 
 		 893 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  35.71 
 
 		 870 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  33.77 
 
 		 921 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1961  DNA gyrase subunit A  33.77 
 
 		 921 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.844346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  35.25 
 
 		 835 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  31.53 
 
 		 840 aa  198  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1286  DNA gyrase, A subunit  37.5 
 
 		 873 aa  198  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  32.67 
 
 		 829 aa  198  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  33.06 
 
 		 900 aa  197  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1230  DNA gyrase subunit A  33.79 
 
 		 879 aa  197  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0017603  normal  0.486018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  32.69 
 
 		 913 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  35.34 
 
 		 751 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  30.2 
 
 		 827 aa  197  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  33.33 
 
 		 856 aa  197  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  33.06 
 
 		 902 aa  197  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000857491  decreased coverage  3.4629599999999997e-25 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  29.3 
 
 		 838 aa  197  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  34.84 
 
 		 828 aa  197  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  35.86 
 
 		 821 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2306  DNA gyrase, A subunit  33.88 
 
 		 905 aa  197  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0379216  hitchhiker  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  28.46 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  34.34 
 
 		 907 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  29.21 
 
 		 871 aa  196  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  34.34 
 
 		 907 aa  197  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2584  DNA gyrase subunit A  33.49 
 
 		 927 aa  197  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216203  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  32.78 
 
 		 864 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  38.07 
 
 		 796 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  32.16 
 
 		 839 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  32.2 
 
 		 862 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1027  DNA topoisomerase IV subunit A  32.99 
 
 		 811 aa  196  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00772659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  36.1 
 
 		 965 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  34.97 
 
 		 818 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  33.33 
 
 		 914 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  32.81 
 
 		 863 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  37.61 
 
 		 775 aa  196  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  34.36 
 
 		 927 aa  196  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2596  DNA gyrase subunit A  33.66 
 
 		 917 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  32.33 
 
 		 864 aa  196  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  34.35 
 
 		 825 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  32.38 
 
 		 839 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  30.91 
 
 		 767 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  32.81 
 
 		 863 aa  195  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0540  DNA gyrase subunit A  37.12 
 
 		 930 aa  195  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0267481  normal  0.364195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2860  DNA gyrase, A subunit  32.03 
 
 		 896 aa  195  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120458  decreased coverage  0.000000000549862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  32.54 
 
 		 913 aa  195  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1949  DNA gyrase, A subunit  32.52 
 
 		 879 aa  195  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0708311  hitchhiker  0.00786865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2876  DNA gyrase subunit A  33.41 
 
 		 925 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.987294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  33.01 
 
 		 913 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  30.13 
 
 		 913 aa  194  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  34.07 
 
 		 904 aa  194  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  31.85 
 
 		 856 aa  194  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>