More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3108 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  49.23 
 
 		 898 aa  803    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 		 914 aa  983    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  54.8 
 
 		 832 aa  958    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  59.58 
 
 		 904 aa  967    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  57.26 
 
 		 977 aa  957    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.13 
 
 		 708 aa  683    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  54.28 
 
 		 906 aa  885    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.49 
 
 		 697 aa  677    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  55.54 
 
 		 897 aa  933    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  58.92 
 
 		 859 aa  1038    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  55.92 
 
 		 864 aa  903    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 846 aa  1732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  40.98 
 
 		 703 aa  485  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  40.19 
 
 		 626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  40.43 
 
 		 490 aa  335  3e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  36.84 
 
 		 922 aa  219  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  30.65 
 
 		 796 aa  217  8e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  37.4 
 
 		 745 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  36.57 
 
 		 934 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  36.03 
 
 		 928 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  35.18 
 
 		 923 aa  213  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  34.71 
 
 		 848 aa  211  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  29.46 
 
 		 807 aa  211  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  34.24 
 
 		 911 aa  210  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  34.64 
 
 		 834 aa  210  8e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  33.6 
 
 		 913 aa  209  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  34.51 
 
 		 914 aa  210  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  34.51 
 
 		 908 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  31.54 
 
 		 788 aa  209  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5027  DNA gyrase, A subunit  34.87 
 
 		 911 aa  208  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.0567458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  34.79 
 
 		 927 aa  208  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  34.87 
 
 		 911 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  36.41 
 
 		 806 aa  208  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  35.54 
 
 		 796 aa  207  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  30.59 
 
 		 811 aa  207  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  35.38 
 
 		 878 aa  207  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  29.32 
 
 		 898 aa  207  9e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3041  DNA gyrase subunit A  32.39 
 
 		 883 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.894078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  35.38 
 
 		 882 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  30.14 
 
 		 752 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  30.59 
 
 		 827 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  35.1 
 
 		 859 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  29.14 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  33.98 
 
 		 828 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  31.7 
 
 		 748 aa  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  31.7 
 
 		 748 aa  206  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  34.73 
 
 		 750 aa  206  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  34.83 
 
 		 902 aa  206  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000857491  decreased coverage  3.4629599999999997e-25 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  31.02 
 
 		 816 aa  206  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2584  DNA gyrase subunit A  34.96 
 
 		 927 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216203  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  33.42 
 
 		 904 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  34.33 
 
 		 807 aa  205  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  34.56 
 
 		 900 aa  204  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  28.62 
 
 		 840 aa  204  5e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  33.68 
 
 		 880 aa  204  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  30.5 
 
 		 840 aa  204  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  33.95 
 
 		 880 aa  203  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  30.7 
 
 		 751 aa  203  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  33.42 
 
 		 893 aa  203  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0221  DNA topoisomerase IV subunit A  29.17 
 
 		 777 aa  203  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  34.48 
 
 		 748 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2978  DNA topoisomerase IV subunit A  31.27 
 
 		 753 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  36.29 
 
 		 750 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1567  DNA topoisomerase IV subunit A  29.89 
 
 		 758 aa  203  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.998235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  34.21 
 
 		 889 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2951  DNA gyrase subunit A  34.54 
 
 		 866 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0195  DNA gyrase subunit A  34.54 
 
 		 866 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2888  DNA gyrase subunit A  34.54 
 
 		 866 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  34.54 
 
 		 866 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  34.54 
 
 		 866 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  28.05 
 
 		 838 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0953  DNA gyrase subunit A  34.54 
 
 		 866 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  34.54 
 
 		 866 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2578  DNA gyrase subunit A  34.54 
 
 		 888 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  36.31 
 
 		 775 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  33.77 
 
 		 864 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  34.17 
 
 		 912 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  35.09 
 
 		 782 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  33.15 
 
 		 893 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  30.33 
 
 		 841 aa  202  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  35.28 
 
 		 833 aa  202  3e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  35.16 
 
 		 899 aa  202  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  34.73 
 
 		 749 aa  202  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.14 
 
 		 793 aa  201  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  36.41 
 
 		 809 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  34.75 
 
 		 767 aa  202  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  32.4 
 
 		 839 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  35.01 
 
 		 767 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  28.86 
 
 		 883 aa  201  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  34.54 
 
 		 889 aa  201  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  34.54 
 
 		 889 aa  201  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1918  DNA gyrase subunit A  33.93 
 
 		 908 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0264462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  32.43 
 
 		 898 aa  201  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  35.01 
 
 		 767 aa  201  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4563  DNA gyrase subunit A  33.95 
 
 		 936 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  33.61 
 
 		 923 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  33.61 
 
 		 919 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 910 aa  201  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  33.52 
 
 		 825 aa  201  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  32.4 
 
 		 839 aa  201  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>