More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2227 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  53.06 
 
 		 864 aa  844    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  47.98 
 
 		 898 aa  805    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  68.36 
 
 		 914 aa  1219    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 904 aa  1845    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  54.15 
 
 		 906 aa  884    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  53.51 
 
 		 897 aa  881    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  54.29 
 
 		 977 aa  896    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.48 
 
 		 708 aa  682    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.86 
 
 		 697 aa  721    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  62.47 
 
 		 859 aa  1092    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  59.58 
 
 		 846 aa  992    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  57.74 
 
 		 832 aa  1030    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  44.44 
 
 		 703 aa  470  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  39.54 
 
 		 626 aa  425  1e-117  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  38.8 
 
 		 490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  38.42 
 
 		 934 aa  204  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  37.85 
 
 		 928 aa  203  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  37.72 
 
 		 923 aa  201  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  38.12 
 
 		 922 aa  201  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  35 
 
 		 848 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  29.04 
 
 		 834 aa  197  9e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  28.45 
 
 		 836 aa  195  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  35.56 
 
 		 819 aa  194  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1052  DNA topoisomerase IV subunit A  32.18 
 
 		 748 aa  194  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0774521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5027  DNA gyrase, A subunit  30.13 
 
 		 911 aa  194  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.0567458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  30.13 
 
 		 911 aa  194  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  34.36 
 
 		 889 aa  194  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  35.58 
 
 		 745 aa  193  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  32.91 
 
 		 807 aa  193  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1182  DNA topoisomerase IV subunit A  31.98 
 
 		 748 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  26.68 
 
 		 853 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  33.8 
 
 		 880 aa  193  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  32.96 
 
 		 880 aa  193  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  35.83 
 
 		 817 aa  192  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  30.3 
 
 		 898 aa  192  2e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  34.05 
 
 		 856 aa  193  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  34.77 
 
 		 907 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  28.86 
 
 		 838 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  31.51 
 
 		 747 aa  192  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  34.77 
 
 		 907 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2432  DNA topoisomerase IV subunit A  35.16 
 
 		 782 aa  191  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  29.96 
 
 		 829 aa  191  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.54 
 
 		 828 aa  190  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  34.81 
 
 		 912 aa  190  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0990  DNA topoisomerase IV subunit A  33.66 
 
 		 748 aa  190  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  32.87 
 
 		 910 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  34.96 
 
 		 913 aa  190  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  29.19 
 
 		 889 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  29.19 
 
 		 889 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1620  DNA gyrase subunit A  31.84 
 
 		 881 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2644  DNA topoisomerase IV subunit A  35.6 
 
 		 751 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0441432  normal  0.463071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  34.72 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  34.48 
 
 		 904 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  27.27 
 
 		 870 aa  189  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  32.12 
 
 		 888 aa  188  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4667  DNA topoisomerase IV subunit A  35.09 
 
 		 750 aa  189  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  32.62 
 
 		 775 aa  188  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.54 
 
 		 855 aa  188  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  32.87 
 
 		 922 aa  189  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3280  DNA gyrase subunit A  31.84 
 
 		 886 aa  188  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.586239  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2584  DNA gyrase subunit A  34.05 
 
 		 927 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216203  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  30.08 
 
 		 893 aa  187  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  34.9 
 
 		 913 aa  187  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  32.35 
 
 		 811 aa  187  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  33.99 
 
 		 812 aa  187  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2238  DNA gyrase subunit A  32.12 
 
 		 873 aa  187  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  26.91 
 
 		 857 aa  187  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  34.41 
 
 		 913 aa  187  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2247  DNA topoisomerase IV subunit A  34.82 
 
 		 749 aa  187  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1396  DNA gyrase subunit A  31.28 
 
 		 877 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.431905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  32.59 
 
 		 923 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1339  DNA gyrase, A subunit  33.87 
 
 		 864 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0126105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  32.59 
 
 		 919 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1272  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.88 
 
 		 775 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2127  DNA topoisomerase IV subunit A  32.24 
 
 		 750 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  27.5 
 
 		 882 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  31.95 
 
 		 830 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  29.65 
 
 		 840 aa  186  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  35.1 
 
 		 911 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  32.59 
 
 		 921 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  27.66 
 
 		 878 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1914  DNA topoisomerase IV subunit A  35.48 
 
 		 749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473924  normal  0.583312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1696  DNA topoisomerase IV subunit A  34.16 
 
 		 767 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1944  DNA topoisomerase IV subunit A  30.94 
 
 		 752 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  33.42 
 
 		 809 aa  186  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2464  DNA gyrase subunit A  31.28 
 
 		 888 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  34.34 
 
 		 767 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  34.6 
 
 		 767 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  31 
 
 		 855 aa  185  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  27.99 
 
 		 848 aa  185  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  28.82 
 
 		 827 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2596  DNA gyrase subunit A  34.27 
 
 		 917 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  27.34 
 
 		 828 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  34.72 
 
 		 908 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  30.91 
 
 		 883 aa  184  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  35.6 
 
 		 750 aa  184  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  35.91 
 
 		 806 aa  184  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  32.68 
 
 		 859 aa  184  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3339  DNA topoisomerase IV subunit A  36.93 
 
 		 748 aa  184  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  30.83 
 
 		 852 aa  184  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>